、萬全等處，指揮使司之在京者稱留守衛(wèi)指揮使司。都指揮司駐在地多與承宣布政使司(即省)駐地相同。另外有些省內(nèi)還設(shè)有“行都指揮使司”，作為輔助。都司以下則轄有衛(wèi)與所等。永樂中定全國都司21，留守司二，內(nèi)外衛(wèi)493，千戶所359，都司、衛(wèi)、所本為軍事性質(zhì)的機(jī)構(gòu)，與政區(qū)無關(guān)。但有些邊境地區(qū)或少數(shù)民族地區(qū)，原缺行政機(jī)構(gòu)或機(jī)構(gòu)遭受破壞而不存，則往往由軍區(qū)管理民事，這樣軍事機(jī)構(gòu)兼管了土地與人民，擁有實(shí)際控制的地域范圍和人口，不屬所在州縣。因而也就轉(zhuǎn)化為政區(qū)性質(zhì)的一種機(jī)構(gòu)，所以在《明史·地理志》中也記載了一些都司衛(wèi)所等名稱。例如在今遼寧境內(nèi)(時(shí)屬山東)的沈陽中衛(wèi)(今沈陽)、鐵嶺衛(wèi)(今鐵嶺)、寧遠(yuǎn)衛(wèi)(今興城)、廣寧中后所(今綏中)、撫順?biāo)?今撫順)，在今寧夏(時(shí)屬陜西)的寧夏中衛(wèi)(今中衛(wèi))、靈武所(今靈武)，在今青海境內(nèi)的西寧衛(wèi)(今西寧市)、歸德所(今貴德)等等。都司、衛(wèi)、所一般都冠以所在地的政區(qū)名或地名，如上各例。

明代政區(qū)與元不同的除了廢除路級(jí)外