nature?子刊：用高通量免疫測序診斷病毒感染

佚名 2024-05-15 00:43:46

藥明康德合作伙伴 adaptive biotechnologies 宣布在《自然》子刊《nature genetics》上發(fā)表創(chuàng)新型研究論文，結(jié)果證明可提供一種潛在的新穎方法診斷慢性病毒感染

。

藥明康德合作伙伴 adaptive biotechnologies 在《nature genetics》上發(fā)表論文

，介紹診斷病毒感染的新方法（圖片來源：《nature genetics》）adaptive biotechnologies 是高通量測序領域的先驅(qū)性公司和領軍企業(yè)之一，其專長于結(jié)合生物信息學來鑒定分析 t 細胞和 b 細胞受體

。這家公司的 immunoseq 平臺幫助科研人員在腫瘤學

、自身免疫疾病、傳染病和基礎免疫學等領域展開前沿研究

。以服務或試劑盒形式

，immunoseq 測定方法可以高度精細地從單個樣品中鑒定分析數(shù)百萬個 t 細胞和 b 細胞受體。該 immunoseq 平臺分析工具可提供定量

、可重復的測序結(jié)果

，加上其強大的訪問功能以及易于使用的特性，adaptive 免疫測序平臺的準確性和靈敏度優(yōu)勢已經(jīng)逐步入駐世界各地的實驗室

，推動癌癥和其他免疫介導疾病的突破性研究

；同時，該公司也將免疫測序發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化為臨床診斷和治療手段

，以改善患者的護理水平

。

adaptive 結(jié)合生物信息學鑒定免疫細胞受體分析（圖片來源：adaptive 官網(wǎng)）這篇題為“immunosequencing identifies signatures of cytomegalovirus exposure history and hla-mediated effects on the t cell repertoire”的文章正是描述了 adaptive 的計算生物學家如何使用該公司的 immunoseq 平臺和數(shù)據(jù)集，通過免疫測序手段來確定分析 t 細胞受體譜系

，最終用于診斷人類巨細胞病毒（cmv）感染的暴露狀態(tài)

。

adaptive 的這項研究是由 fred hutchinson 癌癥研究中心部分資助的。研究共同作者選擇了 cmv 進行原理驗證實驗

，這是因為該疾病約占成年人慢性病毒感染的 30%

？90%，并被廣泛研究后建立成為公眾人群 t 細胞應答的模型系統(tǒng)

。使用公共數(shù)據(jù)

，adaptive 的研究團隊分析了 666 名受試者核心隊列的 t 細胞受體全譜系，以及另外 120 名受試者的獨立驗證隊列

。研究小組制定了一個統(tǒng)計計算框架

，通過 cmv 感染狀態(tài)對受試者進行分類，然后高精度確認了免疫測序方法可被用于診斷 cmv 的感染狀態(tài)

。此外

，該團隊使用這種方法證明它在預測受試者的人類白細胞抗原（hla）等位基因方面也表現(xiàn)良好，表明該方法可用于識別暴露于其他病原體的生物標志

，甚至疫苗接種狀態(tài)

。

adaptive 的聯(lián)合創(chuàng)始人兼創(chuàng)新主管 harlan robins 博士（圖片來源：adaptive 官網(wǎng)）adaptive biotechnologies 的聯(lián)合創(chuàng)始人兼創(chuàng)新主管 harlan robins 博士說道：“我們認為通過讀取 t 細胞記憶來推斷病原體暴露歷史的方法具有令人興奮的潛力

。這是一個重要步驟，我們旨在將免疫測序驗證為針對各種慢性病毒感染的高敏感度

、高特異性和高效益的診斷方法

。”

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