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      Cell:科學(xué)家發(fā)現(xiàn)新型基因突變,為癌癥診斷和治療提供思路

      佚名 2024-05-21 06:23:44

      Cell:科學(xué)家發(fā)現(xiàn)新型基因突變,為癌癥診斷和治療提供思路

      威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院和紐約基因組中心的一項(xiàng)最新研究在癌細(xì)胞內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一種新的基因突變類型

      ,或?yàn)榱私獍┌Y起源提供線索
      ,同時(shí)也為開(kāi)發(fā)新的治療方法提供靶點(diǎn)

      借助下一代基因測(cè)序技術(shù),科學(xué)家們已經(jīng)知道癌癥的根源在于破壞蛋白質(zhì)序列的突變

      。突變會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞合成異常活躍或發(fā)生功能紊亂的蛋白
      ,也會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞無(wú)法合成一些蛋白
      ,最終導(dǎo)致癌癥的發(fā)生。在最近發(fā)表在Cell上的這項(xiàng)研究中
      ,研究人員介紹了一種可能導(dǎo)致癌癥發(fā)生的新型突變:在基因組的非編碼區(qū)域發(fā)生微小DNA序列(1到50個(gè)堿基)的插入或缺失
      ,也叫做“indels”。

      “這些非編碼區(qū)域也有重要作用

      ,因?yàn)樗鼈儼艘恍┠軌蛴绊懟蛘{(diào)控的序列
      。我們已經(jīng)知道這些區(qū)域有非常重要的生物學(xué)意義,問(wèn)題在于這些區(qū)域如何影響癌癥發(fā)育
      ?div id="jpandex" class="focus-wrap mb20 cf">!蔽恼伦髡逥r. Marcin Imielinski教授這樣說(shuō)道。

      在這項(xiàng)研究中

      ,研究人員對(duì)幾個(gè)公共數(shù)據(jù)庫(kù)中腫瘤樣本的基因序列信息進(jìn)行了分析
      ,著重研究基因組中占98%的非蛋白編碼區(qū)域。他們從肺腺癌這種最常見(jiàn)的肺癌開(kāi)始
      ,發(fā)現(xiàn)這些樣本的基因組中最常見(jiàn)的indel突變區(qū)域位于編碼表面活性蛋白的基因中

      之前沒(méi)有研究將這些對(duì)健康肺功能非常重要的基因與肺癌聯(lián)系在一起。但是它們?cè)诎l(fā)展為肺腺癌的細(xì)胞類型中存在高水平特異性的表達(dá)

      研究人員還對(duì)12種其他類型癌癥的基因組進(jìn)行分析

      ,發(fā)現(xiàn)在肝臟、胃和甲狀腺腫瘤中存在類似的模式

      “在每一種癌癥中

      ,非編碼的indel突變都會(huì)聚集在對(duì)器官功能非常重要的基因上,但是這些基因之前都未與癌癥聯(lián)系在一起
      ?div id="jfovm50" class="index-wrap">!盜mielinski教授表示。這些非編碼的indel突變非常常見(jiàn),20%~50%的相關(guān)癌癥中都存在這種突變

      “這種突變發(fā)生的頻率與最著名的致癌突變一樣高

      ,任何基因或序列以這種頻率發(fā)生突變都可能導(dǎo)致癌癥發(fā)生。如果我們可以證明這一點(diǎn)
      ,那將會(huì)是令人感到非常興奮的結(jié)果
      。”

      “這些突變可以用作生物標(biāo)志物幫助我們進(jìn)行癌癥的早期診斷

      ,或者當(dāng)存在轉(zhuǎn)移灶無(wú)法定位原發(fā)灶的時(shí)候可以用于指示原發(fā)灶
      。這項(xiàng)研究的發(fā)現(xiàn)可以有許多可能的臨床應(yīng)用?div id="jfovm50" class="index-wrap">!?/p>

      外國(guó)科學(xué)家發(fā)現(xiàn)HTLV-1病毒誘導(dǎo)炎癥和癌癥的新機(jī)制

      平滑肌細(xì)胞中Nrk之表現(xiàn)具有減緩發(fā)炎與血管內(nèi)膜增生之功能Nature:中風(fēng)引起的腦血管異常與腸道細(xì)菌有關(guān)據(jù)國(guó)外統(tǒng)計(jì)

      ,新冠病毒的感染可能受到自身血型而有所影響外國(guó)科學(xué)家表示,未來(lái)有針對(duì)腎衰竭的新型治療方法 促炎和抗炎細(xì)胞因子的平衡對(duì)于組織動(dòng)態(tài)平衡很重要
      。眾所周知
      ,促炎細(xì)胞因子的過(guò)量產(chǎn)生促進(jìn)了腫瘤的發(fā)展。人類逆轉(zhuǎn)錄病毒1型人類T細(xì)胞白血病病毒(HTLV-1)引起惡性和炎性疾病
      。這項(xiàng)研究表明
      ,HTLV-1將感染細(xì)胞的免疫表型改變?yōu)檎{(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Tregs),并使用抗炎細(xì)胞因子IL-10(而非促炎性IL-6)來(lái)加速感染細(xì)胞的增殖
      。病毒因子HTLV-1 bZIP因子在細(xì)胞因子信號(hào)傳導(dǎo)的這種失調(diào)中起著核心作用
      ,并因此觸發(fā)異常分化T細(xì)胞的發(fā)生。

      IL-6的消失會(huì)促使加速HBZ-Tg小鼠的炎癥和淋巴瘤的形成

      為了評(píng)估HBZ介導(dǎo)的發(fā)病機(jī)制與炎性因子之間的相關(guān)性

      ,我們集中于兩種促炎細(xì)胞因子IFN-γ和IL-6
      ,它們因與癌癥相關(guān)而眾所周知。為了評(píng)估這種可能性
      ,我們通過(guò)將HBZ-Tg小鼠與IL-6 KO小鼠雜交來(lái)產(chǎn)生HBZ-Tg / IL-6 KO小鼠(20)
      ,并將它們的表型與HBZ-Tg小鼠的表型進(jìn)行比較。正如我們先前研究所提到
      ,到24周齡時(shí)
      ,約有45%的HBZ-Tg小鼠發(fā)展為皮炎(圖1A和表1)和組織病理學(xué)分析顯示,其中30%在那個(gè)年齡有淋巴瘤(圖1C和表1)
      。令人驚訝的是
      ,HBZ-Tg / IL-6 KO小鼠患皮炎的時(shí)間明顯早于HBZ-Tg小鼠(中位值分別為86 d和255 d;危險(xiǎn)比[HR]為0.1726
      ; 95%置信區(qū)間[CI]為0.09454至0.3152) (圖1A)

      外,每12只HBZ-Tg / IL-6 KO小鼠中有10只(83%)在24周齡時(shí)出現(xiàn)淋巴瘤(圖1 C和D和表1)

      。在WT和IL-6 KO小鼠中均未觀察到皮炎和淋巴瘤
      ,并且親本菌株之間的總存活率沒(méi)有顯著差異
      。這些結(jié)果表明IL-6的喪失加速了體內(nèi)HBZ引起的炎癥和淋巴瘤的發(fā)展。

      IL-6的丟失會(huì)加速HBZ-Tg小鼠的炎癥和淋巴瘤的形成

      。(圖源:PNAS)

      HBZ-Tg / IL-6 KO小鼠體內(nèi)產(chǎn)生IL-10的CD4 + T細(xì)胞增多

      為了確認(rèn)HBZ-Tg / IL-6 KO小鼠的免疫表型,我們接下來(lái)分析了CD4 + T細(xì)胞中的T細(xì)胞亞群和細(xì)胞因子的產(chǎn)生

      。分離來(lái)自4周齡小鼠的脾細(xì)胞,并進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)分析
      。效應(yīng)記憶T細(xì)胞和CD4的百分比+ Foxp3的+與WT和IL-6 KO小鼠
      。在28周齡的小鼠中,HBZ-Tg / IL-6 KO小鼠的Foxp3 + T細(xì)胞百分比明顯高于HBZ-Tg小鼠

      由于HBZ通過(guò)激活TGF-β/ Smad信號(hào)傳導(dǎo)途徑誘導(dǎo)Foxp3

      ,這些結(jié)果顯示,剔除HBZ-Tg小鼠的IL-6可以增強(qiáng)HBZ的作用
      ,該作用將CD4 + T細(xì)胞分化為Treg樣
      。組織病理學(xué)分析顯示,與HBZ-Tg小鼠相比
      ,HBZ-Tg / IL-6 KO小鼠的淋巴瘤組織中Foxp3 +細(xì)胞的百分比更高
      。我們還發(fā)現(xiàn),與HAM / TSP患者和無(wú)癥狀攜帶者(AC)中的非白血病感染細(xì)胞相比
      ,ATL患者的白血病細(xì)胞中Foxp3 +細(xì)胞顯著增加
      。這些發(fā)現(xiàn)表明Foxp3表達(dá)與HTLV-1的致癌作用有關(guān)。

      轉(zhuǎn)錄組分析揭示了HBZ-Tg / IL-6 KO小鼠的發(fā)病機(jī)理和相關(guān)基因

      為了了解與HBZ-Tg小鼠相比HBZ-Tg / IL-6 KO小鼠中炎癥和腫瘤發(fā)生加速的分子機(jī)制

      ,我們使用來(lái)自四種品系WT,HBZ-Tg的脾CD4 + T細(xì)胞進(jìn)行了RNA -seq分析
      ,IL-6 KO和HBZ-Tg / IL-6 KO
      。我們假設(shè)HBZ和IL-6的丟失將在促進(jìn)炎癥和淋巴瘤的形成中協(xié)同作用。我們首先確認(rèn)了RNA-seq結(jié)果與我們先前發(fā)表的通過(guò)微陣列和定量RT-PCR獲得的結(jié)果相符
      ;許多HBZ靶基因
      ,包括Ccr4,Trp73
      ,Neo1
      ,Tigit和Cxcr3,被再現(xiàn)地鑒定
      。 HBZ-Tg小鼠與WT小鼠的比較表明
      ,在該研究中1,035個(gè)基因被上調(diào),而469個(gè)基因被下調(diào)(圖3 A和B)

      每個(gè)菌株中脾CD4 + T細(xì)胞的表達(dá)譜

      。(圖源:PNAS)

      每個(gè)菌株中脾CD4 + T細(xì)胞的表IL-10是一種免疫調(diào)節(jié)性細(xì)胞因子

      ,對(duì)于抑制過(guò)度的免疫活化和隨后的組織損傷至關(guān)重要。幾種病毒利用IL-10的免疫抑制功能建立持續(xù)感染
      。 IL-10抑制樹(shù)突狀細(xì)胞(DC)和引線的T細(xì)胞的耗竭
      。許多潛伏病毒(例如幾種皰疹病毒)在其基因組中編碼IL-10同源物,這表明誘導(dǎo)細(xì)胞/病毒IL-10是逃避宿主免疫系統(tǒng)的有效策略

      總之

      ,HTLV-1編碼的病毒蛋白HBZ通過(guò)誘導(dǎo)感染細(xì)胞分化為具有Treg樣特征的細(xì)胞,增加IL-10的產(chǎn)生并調(diào)節(jié)IL-10在HTLV-1介導(dǎo)的發(fā)病機(jī)制中起著核心作用
      。 / JAK / STAT信號(hào)指示淋巴增生狀態(tài)(圖6)
      。這項(xiàng)研究證明了HBZ和免疫調(diào)節(jié)細(xì)胞因子之間以前未知的聯(lián)系,詳細(xì)機(jī)制的闡明可有助于開(kāi)發(fā)治療HTLV-1誘導(dǎo)的難治性疾病的新策略

      HBZ介導(dǎo)的T細(xì)胞增殖示意圖

      。HBZ和IL-6的丟失增強(qiáng)了Treg的分化和IL-10的產(chǎn)生。IL-10的增加會(huì)激活STAT蛋白
      ,HBZ會(huì)調(diào)節(jié)IL-10 / JAK / STAT信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)為促炎和增生特性
      。(圖源:PNAS)

      臺(tái)灣多數(shù)肺癌患者沒(méi)吸菸
      ,致命基因突變影響細(xì)胞癌化!

      【吳慧禎】肺癌是全球癌癥死亡的主因

      ,即使藥物治療近年有長(zhǎng)足的進(jìn)展
      ,5年存活率仍低于20%,目前肺癌蟬聯(lián)多年兩性10大癌癥之首
      ,號(hào)稱臺(tái)灣人癌癥死亡頭號(hào)殺手
      。 在美國(guó),不吸菸的人大概只占肺癌患者的2成
      ,肺癌傳統(tǒng)也被認(rèn)為與吸菸畫上等號(hào)
      ,不過(guò),臺(tái)灣的不吸菸肺癌患者卻比吸菸者多
      ,根據(jù)統(tǒng)計(jì)
      ,在臺(tái)灣有50%以上的肺癌病患并不吸菸,超過(guò)一半
      ,尤其這些年來(lái)「不吸菸女性」罹患肺癌人數(shù)逐年攀升
      ,竟有超過(guò)9成得肺癌的女性都不抽菸,還有年輕化的趨勢(shì)
      ,在女性十大癌癥發(fā)生率排行榜中名列第三
      。 (編輯推薦:肺癌不一定咳嗽,不抽菸也會(huì)得肺癌
      !預(yù)防肺癌哪些檢查你該做
      ?) 癌癥成因相當(dāng)復(fù)雜
      ,基因背景、人體老化
      、飲食環(huán)境等等
      ,想要確切診斷與治療,癌癥患者的背景與罹病機(jī)制或許都有一定關(guān)系
      。 如今
      ,臺(tái)灣研究團(tuán)隊(duì)針對(duì)肺癌致病機(jī)制有了新發(fā)現(xiàn),中研院召開(kāi)記者會(huì)公布最新肺癌醫(yī)療研究結(jié)果
      ,由中研院化學(xué)研究所陳玉如所長(zhǎng)
      、臺(tái)大醫(yī)學(xué)院內(nèi)科教授楊泮池與跨單位研究團(tuán)隊(duì),找到了不吸菸肺癌患者可能的致病機(jī)制
      。 研究主要有三個(gè)發(fā)現(xiàn),首先是癌細(xì)胞基因突變結(jié)果顯示
      ,肺癌和體內(nèi)酵素APOBEC突變特征的高低有關(guān)
      ,其次則是與致癌物的曝露有關(guān);最后更發(fā)現(xiàn)一個(gè)從未被發(fā)現(xiàn)的新亞型肺癌
      ,及其致癌基因突變的差異
      ,有助早期發(fā)現(xiàn)臨床潛在的高風(fēng)險(xiǎn)肺癌患者。 (編輯推薦:肺癌風(fēng)險(xiǎn)高10倍
      !不可忽視的肺部5大隱形殺手有哪些
      ?) 臺(tái)灣半數(shù)肺癌患者沒(méi)吸菸!中研院找到 肺癌致病關(guān)鍵 為厘清不吸菸罹肺癌的致病機(jī)制
      ,此研究分析東亞地區(qū)103名肺癌病患
      ,探究早期不吸菸肺癌的發(fā)病與進(jìn)展。 癌細(xì)胞基因突變結(jié)果顯示
      ,東西方病人突變的基因背景大為不同
      ;肺腺癌癌變與APOBEC的突變特征很有關(guān)。罹癌患者中
      ,高達(dá)74%從未吸菸年輕女性(小于60歲)和所有無(wú)肺癌「表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)」 驅(qū)動(dòng)突變的女性患者APOBEC突變特征程度高
      ,顯示 APOBEC的突變特征可能為女性早期肺癌的驅(qū)動(dòng)因素 。 而高APOBEC突變特征又與免疫療法療效呈正相關(guān)
      。因此
      ,APOBEC突變特征可能成為早期診斷和免疫治療的潛在生物標(biāo)志物。 此外
      ,研究也發(fā)現(xiàn)
      ,暴露于致癌物而引起的基因體編輯突變特征,亦可能是癌癥早期的主要驅(qū)動(dòng)因素
      。在部分大于70歲的較年長(zhǎng)女性中程度較高
      ,化學(xué)致癌物代謝和解毒過(guò)程及特定途徑的活化可能影響腫瘤癌化
      、惡化和免疫調(diào)節(jié)異常。換言之
      ,減少生活中致癌物的暴露率
      ,是預(yù)防肺癌最有效的策略之一。 發(fā)現(xiàn)「新亞型」肺癌
      !有助早期發(fā)現(xiàn)潛在高風(fēng)險(xiǎn)肺癌患者 過(guò)去研究已知
      ,臺(tái)灣肺癌患者主要在EGFR基因上會(huì)發(fā)生Del19和L858R兩種突變,病患若是發(fā)生L858R突變
      ,存活率比較低
      ,且容易產(chǎn)生惡性胸腔積液和癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移,不過(guò)至今仍未發(fā)現(xiàn)明確的生物機(jī)轉(zhuǎn)
      。而本次研究透過(guò)蛋白體學(xué)特征可將肺腺癌分為5個(gè)亞型
      ,其中有一個(gè)從未被發(fā)現(xiàn)的新型早期肺癌「類晚期」亞型。 此亞型可區(qū)分出Del19和L858R突變的腫瘤在早期癌癥的惡性特征
      。因此
      ,臨床醫(yī)師有機(jī)會(huì)可藉惡性特征發(fā)現(xiàn)早期肺癌患者,進(jìn)一步提供密集的監(jiān)測(cè)和考慮可能的佐劑加以治療
      。此外
      ,「類晚期」亞型的早期腫瘤也可發(fā)現(xiàn)顯著增加的蛋白,如間質(zhì)溶解素MMP11等
      ,可能可以作為檢測(cè)的生物標(biāo)志
      。 臺(tái)美「癌癥登月計(jì)畫」重大發(fā)現(xiàn),精準(zhǔn)醫(yī)療研究登頂尖期刊 肺癌團(tuán)隊(duì)主持人楊泮池指出
      ,「蛋白基因體學(xué)發(fā)現(xiàn)不吸菸肺癌患者在腫瘤發(fā)生和癌癥進(jìn)程上存在著人種和地域上的獨(dú)特性
      ,此研究為早期不吸菸者肺腺癌提供了新的見(jiàn)解」。 除中研院之外
      ,該跨單位研究團(tuán)隊(duì)成員由臺(tái)灣大學(xué)
      、臺(tái)北醫(yī)學(xué)大學(xué)、臺(tái)中榮總提供病人檢體
      、臨床數(shù)據(jù)及檢測(cè)技術(shù)
      。研究主持人陳玉如表示,「這是東亞第一套結(jié)合深度多體學(xué)大數(shù)據(jù)及完整臨床資料
      ,深度解析不吸菸肺癌成因的研究成果」
      ,也是美國(guó)臨床蛋白基因體學(xué)腫瘤分析聯(lián)盟(CPTAC)首次和國(guó)際聯(lián)盟團(tuán)隊(duì)(臺(tái)灣)攜手合作,以蛋白基因體學(xué)揭開(kāi)臺(tái)灣及美國(guó)病人肺癌生物學(xué)的面紗
      。 臺(tái)美二個(gè)獨(dú)立成果于今(2020)年7月9日同步發(fā)表在國(guó)際頂尖期刊《細(xì)胞》《Cell》上
      ,并共同登上該期雜志封面。 參考資料: 論文全文連結(jié):Cell〈Proteogenomics of Non- *** oking Lung Cancer in East Asia Delineates Molecular Signatures of Pathogenesis and Progression〉

      本文地址:http://www.mcys1996.com/jiankang/276210.html.

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      榆錢怎么吃,春天嘗鮮就吃榆錢
      春季嘗鮮吃榆錢雖然榆錢寓意著富余
      ,但對(duì)50多歲的不少人來(lái)說(shuō)卻是帶點(diǎn)痛苦的記憶
      。在生活困難時(shí)期,野菜
      、樹(shù)皮
      、樹(shù)葉……能吃的不能吃的,為了活命都嘗試過(guò)
      。到了我們這一代
      癌痛到底是陣痛還是持續(xù)痛?如何才能緩解
      ?一文科普
      ,不妨看看!
      癌痛指的是癌性疼痛
      ,是由于患上各種癌癥
      ,引起了神經(jīng)受壓等問(wèn)題,從而使患者產(chǎn)生的疼痛現(xiàn)象
      。有很多人認(rèn)為
      ,癌痛屬于陣發(fā)性的疼痛,只要適當(dāng)服用藥物就能夠起到快速止痛的作用
      。但有不少人認(rèn)為
      ,癌痛屬于劇烈且持續(xù)性的疼痛。那么
      ,癌痛到底是陣痛還是持續(xù)性
      2023-08-13
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      ?如何才能緩解?一文科普
      ,不妨看看
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