阿根廷科學(xué)家近日成功將該國(guó)國(guó)歌旋律以人工基因編碼形式植入某種細(xì)菌染色體中。這一方法不僅可以用來(lái)存儲(chǔ)音樂(lè)旋律,還可能發(fā)展為一種擁有巨大應(yīng)用潛力的信息存儲(chǔ)方式。
據(jù)阿根廷媒體報(bào)道,主持研究的阿根廷信息生物學(xué)家費(fèi)德里克?普拉達(dá)介紹說(shuō),生物的dna(脫氧核糖核酸)由四種脫氧核苷酸組成,即腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鳥(niǎo)嘌呤,分別用字母a、t、c、g表示。研究人員通過(guò)不同組合對(duì)四種核苷酸進(jìn)行編碼,使之對(duì)應(yīng)不同的音符,然后將音符按照阿根廷國(guó)歌的旋律排列,并植入某種細(xì)菌的染色體中。
據(jù)介紹,被植入細(xì)菌染色體的基因片段以一條dna鏈形式存在,這條dna鏈雖然經(jīng)過(guò)人為修改,但是在細(xì)菌繁殖過(guò)程中也會(huì)被精確復(fù)制。由于這條修改過(guò)的dna鏈存在于細(xì)胞質(zhì)粒而非細(xì)胞核中,也不會(huì)影響細(xì)菌正常的生理活動(dòng)。
普拉達(dá)說(shuō),這是一種有巨大應(yīng)用潛力的信息存儲(chǔ)方式。首先細(xì)菌繁殖能力很強(qiáng),一般20分鐘就可以復(fù)制一次,如同一個(gè)“生物復(fù)印機(jī)”。更重要的是,這種方法可以帶來(lái)強(qiáng)大的存儲(chǔ)能力,一個(gè)擁有6萬(wàn)冊(cè)藏書(shū)的圖書(shū)館,如果以人工基因編碼形式存放在細(xì)菌染色體中,將只有0.01克,存儲(chǔ)的信息還可以隨時(shí)提取。
該項(xiàng)目研究小組還專(zhuān)門(mén)建立了一個(gè)網(wǎng)站,網(wǎng)站上設(shè)有一個(gè)轉(zhuǎn)換系統(tǒng),當(dāng)用戶上傳一段音樂(lè)旋律后,網(wǎng)站會(huì)自動(dòng)轉(zhuǎn)換為基因編碼。目前該網(wǎng)站只能接受midi格式音樂(lè),研究人員正在進(jìn)一步完善系統(tǒng),不久后就可以接受任何格式的數(shù)碼音樂(lè)。
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問(wèn)題描述:
有人知道Red重組技術(shù)是什么嗎?具體的操作步驟是如何的?
解析:
伴隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,一種基于λ噬菌體Red重組酶的同源重組系統(tǒng)已應(yīng)用于大腸桿菌基因工程研究.Red重組系統(tǒng)由三種蛋白組成:Exo蛋白是一種核酸外切酶,結(jié)合在雙鏈DNA的末端,從5'端向3'端降解DNA,產(chǎn)生3'突出端;Beta蛋白結(jié)合在單鏈DNA上,介導(dǎo)互補(bǔ)單鏈DNA退火;Gam蛋白可與RecBCD酶結(jié)合,抑制其降解外源DNA的活性.Red同源重組技術(shù)具有同源序列短(40~60 bp)、重組效率高的特點(diǎn).這種技術(shù)可在DNA靶標(biāo)分子的任意位點(diǎn)進(jìn)行基因敲除、敲入、點(diǎn)突變等操作,無(wú)需使用限制性內(nèi)切酶和連接酶.此外,這種新型重組技術(shù)可直接將目的基因克隆于載體上,目的基因既可來(lái)源于細(xì)菌人工染色體也可是基因組DNA.Red同源重組技術(shù)使難度較大的基因工程實(shí)驗(yàn)順利進(jìn)行,大大推動(dòng)功能基因組研究的發(fā)展.
當(dāng)今生物學(xué)與醫(yī)學(xué)科學(xué)中,最強(qiáng)大的工具之一就是人工除去或補(bǔ)充DNA片段到生物體基因組中的能力。這個(gè)能力已幫助科學(xué)家了解了許多由于基因缺陷引起的問(wèn)題,如今基因缺陷已與數(shù)千種疾病聯(lián)系在一起。迄今這種增刪DNA的技術(shù)還只局限于小DNA片斷。但4年前,德國(guó)海德堡歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的Francis Stewart和他的同事發(fā)明了一種可以改造細(xì)菌中更長(zhǎng)片段的DNA的新技術(shù)(-db.embl-heidelberg.de/jss/servlet/de.embl.bk.Tools.GroupLeftEMBL/ExternalInfo/stewart/ETcloning-textonly,)。現(xiàn)在德國(guó)生物技術(shù)大學(xué)工作的原歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室研究人員又用這一個(gè)方法改造了一個(gè)小鼠基因,使其產(chǎn)生一系列復(fù)雜變化,目的是能對(duì)人類(lèi)的白血病有更多了解。他們的研究結(jié)果發(fā)表在最新一期的《自然生物技術(shù)》(Nature Biotechnology)上。
在過(guò)去的20年里,研究人員已學(xué)會(huì)將細(xì)菌用作“復(fù)制機(jī)器”,復(fù)制提取自其它生物的DNA。這是生物技術(shù)一次飛躍,因?yàn)榇蠖鄶?shù)類(lèi)型的研究都需要某一分子的數(shù)十億拷貝用于研究。然而,這也存在一個(gè)局限:研究人員需要精確改變DNA分子,而對(duì)于大分子而言,復(fù)制出這么多拷貝極為困難。
Stewart和他的同事認(rèn)為,細(xì)菌經(jīng)過(guò)培訓(xùn),可以做得更好,因此他們借用了小鼠和酵母等生物使用的一個(gè)修復(fù)斷裂DNA的策略。稱(chēng)為重組酶的蛋白在細(xì)胞中循環(huán),尋找序列熟悉的松散DNA片段。
“重組酶認(rèn)定,這些片段已被錯(cuò)誤地剪切出DNA,因而它們竭力將片段重新粘到基因組的正確位置上?!痹撗芯康念I(lǐng)導(dǎo)人Giuseppe Testa說(shuō)?!坝袝r(shí)這些重組酶有點(diǎn)勤奮過(guò)頭了,它們會(huì)將看上去完全正常的片段如研究人員導(dǎo)入到細(xì)胞中的一個(gè)基因變異也重組到基因組中?!?
這個(gè)過(guò)程稱(chēng)為同源重組,它的運(yùn)行有點(diǎn)象計(jì)算機(jī)程序中的“查找和替換”命令。想象一下你打了滿篇“Stephen Q. Gould”,然后突然發(fā)現(xiàn)中間的字母應(yīng)該是“J”。計(jì)算機(jī)可以接受命令查找Stephen和Gould,然后替換二者之間的字母。同樣,重組酶也是先找到一個(gè)目標(biāo)靶左右可識(shí)別的DNA序列,然后用新序列替換左右可識(shí)別DNA之間的片段。
同源重組已知發(fā)生于細(xì)菌中,但不可能將其用于DNA改造,象酵母和小鼠干細(xì)胞中的那樣。Stewart的研究小組決心找到一個(gè)能夠完成此任務(wù)的細(xì)菌株?!拔覀儽M可能訂購(gòu)各種類(lèi)型大腸桿菌(E. coli)株?!彼f(shuō)?!敖?jīng)過(guò)了5個(gè)月的工作,我們實(shí)驗(yàn)室的博士后研究人員Youming Zhang終于找到了這樣一個(gè)菌株?!?
研究小組迅速識(shí)別出有關(guān)的細(xì)菌因子,將它們轉(zhuǎn)化為一個(gè)新工具--Red/ET重組,該技術(shù)現(xiàn)在正被全世界的生物學(xué)家采用。該技術(shù)是Stewart與它在歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的同事創(chuàng)立的生物技術(shù)公司--基因橋GmbH的一個(gè)中流砥柱。該公司致力于開(kāi)發(fā)這個(gè)技術(shù)突破的商業(yè)用途。
“我們一直致力于對(duì)該技術(shù)進(jìn)行改進(jìn),使其可以在越來(lái)越大的DNA片段中工作。”Testa說(shuō)?!拔覀冏钚碌挠?jì)劃就是改造細(xì)菌的一條全長(zhǎng)染色體。我們構(gòu)建了一個(gè)復(fù)雜的大‘匣子’,現(xiàn)在我們已經(jīng)將這個(gè)匣子插入到小鼠中,替代正?;颉!?
研究人員選擇的基因叫做混合世襲白血病基因(mixed-lineage leukemia,Mll),已知白血病兒童攜帶該基因的缺陷版本。研究希望通過(guò)插入該基因的人工版本到小鼠中能夠揭示Mll缺陷是如何導(dǎo)致白血病的?!斑@個(gè)基因的許多地方都可能發(fā)生故障。”Testa,“我們想構(gòu)建一個(gè)使我們能夠盡可能檢測(cè)到多方面問(wèn)題的版本?!?
插入到小鼠中的人工Mll基因允許研究人員進(jìn)行各種實(shí)驗(yàn)。它的遺傳序列中含有兩個(gè)與白血病有關(guān)的缺陷。這個(gè)匣子還含有允許每個(gè)缺陷在研究人員需要的任何時(shí)候被“打開(kāi)”的控制開(kāi)關(guān);當(dāng)然,它們也可以被關(guān)閉?!拔覀兛梢元?dú)立研究每一個(gè)突變,也可以觀察它們一起時(shí)是怎樣活動(dòng)的,還可以控制每一個(gè)缺陷活動(dòng)的時(shí)間?!盩esta說(shuō)?!斑@將使我們對(duì)多個(gè)基因缺陷之間的微妙關(guān)系有一個(gè)新認(rèn)識(shí)?!?
許多疾病都是與某一個(gè)基因突變有關(guān);然而,疾病易感性往往還取決于其它序列變異,也就是我們所說(shuō)的多態(tài)性?!癕ll匣子大體上展示了研究興趣基因的一個(gè)突變及其相關(guān)多態(tài)性的簡(jiǎn)便方法。”Testa說(shuō)?!斑@種制造小鼠模型的方法對(duì)于構(gòu)建人類(lèi)疾病易感性和生物體對(duì)藥物反應(yīng)方式的可信模型將會(huì)越來(lái)越重要,我們認(rèn)為我們的工作展示了建立這些模型的方法?!?
這項(xiàng)新研究還預(yù)示著基因組工程新時(shí)代的來(lái)臨?!癕ll匣子是首次展示我們可以如何操作大DNA分子?!盨tewart說(shuō)?!癛ed/ET重組增加了DNA的大小,使其可以輕松被改造十多次?!?/p>
南極冰蓋可以說(shuō)是如今地球上最為神秘的地方之一,多年來(lái),全球科學(xué)家經(jīng)過(guò)多次探測(cè)研究,目前了解的還只是屬于冰山一角。為了研究南極冰蓋,俄羅斯科學(xué)家陸陸續(xù)續(xù)鉆探了20年時(shí)間,這不禁讓人有些好奇,南極冰蓋之下到底有什么?
南極冰蓋位于南極洲東部,占地近 1400 萬(wàn)平方公里,覆蓋了南極大陸約 98% 的面積,平均厚度約2450米,是地球上兩個(gè)極地冰蓋之一,另一個(gè)是格陵蘭冰蓋。南極冰蓋是由大氣冰組成的,利用常年低溫和終年不化的降雪年復(fù)一年地積累,壓實(shí)成冰,逐漸從大陸中心蔓延到邊緣,通過(guò)研究可以看出,地表的冰是現(xiàn)代的,越往下時(shí)間越長(zhǎng)。
從20世紀(jì)60年代以來(lái),經(jīng)過(guò)科學(xué)家多次探測(cè),已經(jīng)用冰雷達(dá)在南極冰蓋下發(fā)現(xiàn)了約400多個(gè)冰下湖。冰下湖這個(gè)概念是來(lái)自19世紀(jì)俄羅斯的一位科學(xué)家,他表示在冰體的壓力下,冰蓋內(nèi)部溫度會(huì)慢慢上升,最后會(huì)融化成淡水形成了“冰下湖”,后來(lái)在不斷探測(cè)中被證實(shí)。
其中最大的冰下湖是由俄羅斯南極考察站東方站鉆探出來(lái)的,命名為“沃斯托克湖”(俄語(yǔ)東方為沃斯托克)。從1990年代初期開(kāi)始,俄羅斯、法國(guó)、美國(guó)的研究專(zhuān)家一起鉆探,通過(guò)融冰技術(shù)(即熱鉆)和機(jī)械鉆探技術(shù)陸陸續(xù)續(xù)不斷 探索 。
直到2012年,俄羅斯持續(xù)20年的鉆探項(xiàng)目取得了成功,科學(xué)家宣布,他們鉆透了3769.3米的南極冰蓋,到達(dá)了沃斯托克湖表層。據(jù)科學(xué)家推測(cè),沃斯托克湖大約在1500萬(wàn)年前形成的,而之后就一直沒(méi)有什么大的變化,這也讓科學(xué)家不由感到好奇這個(gè)湖里會(huì)不會(huì)有生命存在呢?
于是俄羅斯科學(xué)家取來(lái)湖中的水樣進(jìn)行研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)了一種新的細(xì)菌。據(jù)刊登在《公共科學(xué)圖書(shū)館-綜合》雜志上的研究表明,湖水樣本中有超過(guò)3500種不同的DNA序列,其中有大約95%與細(xì)菌聯(lián)系在一起。
另外,科學(xué)家在這些DNA序列里發(fā)現(xiàn)了不同類(lèi)型的節(jié)肢動(dòng)物、水蚤、真菌和軟體動(dòng)物等,而有些細(xì)菌通常是寄生在魚(yú)類(lèi)中的,這也可以說(shuō)明沃斯托克湖中可能存在魚(yú)類(lèi)生物。
除此之外,英國(guó)生物學(xué)家也在南極冰架下的巨石上發(fā)現(xiàn)了海洋生物,其中16只海綿,還有22 只“不明生物”,其中可能包括藤壺,據(jù)英國(guó)南極調(diào)查員表示,他認(rèn)為這些動(dòng)物可能是濾食性動(dòng)物,靠水中攜帶的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)生存。
隨著全球變暖,南極冰蓋融化顯著,據(jù)《全球生態(tài)環(huán)境遙感監(jiān)測(cè)2020年度報(bào)告》中顯示,從1999年-2019年,南極冰蓋融化面積達(dá)263.4萬(wàn)平方公里,約有3萬(wàn)億噸的冰川融化,有些地方已經(jīng)出現(xiàn)裂縫和冰坑,如果這些冰蓋全部融化的話,將會(huì)導(dǎo)致海平面上升約58米。
冰蓋融化不僅會(huì)導(dǎo)致海平面上升,還會(huì)對(duì)周?chē)淖匀画h(huán)境和沿海地區(qū)都會(huì)造成嚴(yán)重的影響。約10萬(wàn)年前,南極曾有一塊冰蓋融化,導(dǎo)致世界范圍的海平面上升了約9米左右,海水淹沒(méi)了大片陸地。
一直以來(lái),全球變暖都是人類(lèi)面臨的巨大挑戰(zhàn),如果全球變暖的問(wèn)題不斷加重,同樣的事件可能會(huì)再次發(fā)生。
據(jù)最新研究表示,如果能實(shí)現(xiàn)2015年“巴黎氣候協(xié)定”上定的減排目標(biāo),可能會(huì)避免災(zāi)難性后果,南極冰蓋也不會(huì)受太大影響。不過(guò)溫室氣體排放量持續(xù)不變的話,到2100年,海平面可能會(huì)上升超過(guò)1米,到了2500年可能超過(guò)15米。
所以,阻止全球變暖是全人類(lèi)的事情,希望盡快推動(dòng)減排政策,推動(dòng)能源利用效率,減少污染物排放,持續(xù)改善生態(tài)環(huán)境。
希望能夠幫到你
世界首個(gè)“人造生命”日前在美國(guó)誕生,現(xiàn)在人類(lèi)的能力已經(jīng)拓展到可以“操縱”自然界。不過(guò)這一科技突破也引來(lái)不少詬病,批評(píng)人士說(shuō)人類(lèi)怎能堪當(dāng)“造物主”之職,而美國(guó)總統(tǒng)奧巴馬也下令在下周舉行聽(tīng)證會(huì),討論這一問(wèn)題。綜合新華社、《中國(guó)日?qǐng)?bào)》報(bào)道
合成DNA讓細(xì)菌“起死回生”
項(xiàng)目的負(fù)責(zé)人J·克雷格·文特爾將“人造生命”起名為“辛西婭”(Synthia,意為“人造兒”)。他表示:“‘辛西婭’其實(shí)是一個(gè)人工合成的基因組,是第一個(gè)人工合成的細(xì)胞,也是第一種以計(jì)算機(jī)為父母的可以自我復(fù)制的生物?!?br>
項(xiàng)目組其他成員表示,這僅僅是一個(gè)更宏大工程的一小步,未來(lái)他們甚至可以根據(jù)客戶需求提供“定制”的有機(jī)物。此外,未來(lái)科學(xué)家還可以制造出能夠產(chǎn)出石油或?qū)R远趸紴槭车沫h(huán)境友好型“人造生命”。文特爾自信地說(shuō),“人造生命”將成為非常強(qiáng)大有用的生物學(xué)工具。
實(shí)驗(yàn)中,科研人員先將“山羊支原體”的內(nèi)部挖空,再向其中注入“蕈狀支原體”的DNA(脫氧核糖核酸),最后新的支原體終于開(kāi)始自我繁殖,成為世界首個(gè)“人造生命”。
雖然實(shí)驗(yàn)原理聽(tīng)起來(lái)很簡(jiǎn)單,但是科研人員在15年間花費(fèi)4000萬(wàn)美元才得以成功,其中的難點(diǎn)就在于如何讓人造基因序列生成人造染色體??茖W(xué)家經(jīng)過(guò)多年反復(fù)的實(shí)驗(yàn),終于攻克了所有技術(shù)難題,制造出了“人造生命”。此次植入的DNA片段包含約850個(gè)基因,而人類(lèi)的DNA圖譜上共有約20000個(gè)基因。
奧巴馬下令評(píng)估風(fēng)險(xiǎn)
文特爾稱(chēng)在實(shí)驗(yàn)開(kāi)始前他已經(jīng)請(qǐng)教過(guò)許多倫理領(lǐng)域的專(zhuān)家,并向白宮匯報(bào)過(guò)此事。然而實(shí)驗(yàn)成功的消息公布后,還是招致許多人的批評(píng),有人稱(chēng)無(wú)論如何人類(lèi)都不可以充當(dāng)“造物主”,更沒(méi)有資格像“上帝”或諸神一樣創(chuàng)造生命;更多人則擔(dān)心此研究成果會(huì)被用來(lái)合成大量生化武器,造成恐怖威脅。
不過(guò)也有人稱(chēng)贊文特爾的研究具有劃時(shí)代的意義。賓州大學(xué)的生物倫理學(xué)家亞瑟·卡普蘭說(shuō):“研究成果可以徹底平息有關(guān)生命到底需不需要特殊力量才能被創(chuàng)造和生存下來(lái)的爭(zhēng)論,甚至可以顛覆人類(lèi)長(zhǎng)久以來(lái)對(duì)于生命本質(zhì)的看法,讓人們重新審視自身和人類(lèi)在宇宙中的地位,其深遠(yuǎn)意義堪比伽利略、哥倫布、達(dá)爾文和愛(ài)因斯坦等先賢對(duì)人類(lèi)發(fā)展做出的貢獻(xiàn)?!?br>
目前,奧巴馬已經(jīng)敦促生物倫理委員會(huì)督察此事,“評(píng)估此研究將給醫(yī)學(xué)、環(huán)境、安全等領(lǐng)域帶來(lái)的任何潛在影響、利益和風(fēng)險(xiǎn),并向聯(lián)邦政府提出行動(dòng)建議,保證美國(guó)能夠在倫理道德的界限之內(nèi)、以最小的風(fēng)險(xiǎn)獲得此研究成果帶來(lái)的利益”。
這是世界上第一個(gè)人造細(xì)胞。我們稱(chēng)它為‘人造兒’,因?yàn)檫@個(gè)細(xì)胞完全來(lái)自于合成的染色體,用4瓶化學(xué)物質(zhì)在一個(gè)化學(xué)合成器下制造出來(lái)的。這是地球上第一個(gè)父母是電腦、卻可以進(jìn)行自我復(fù)制的物種。 ”——克雷格·文特爾
克雷格是誰(shuí)?
克雷格·文特爾是一名具有爭(zhēng)議的生物學(xué)家,同時(shí)也是一名財(cái)產(chǎn)過(guò)十億的企業(yè)家??茖W(xué)界一些人質(zhì)疑他將基因組研究活動(dòng)變成一種相互競(jìng)爭(zhēng)的比賽。他1946年出生,曾在越南服役,在照顧傷兵時(shí)決心從醫(yī)。1992年成立了私人的基因組研究所。約3年后,成功分析出一種導(dǎo)致幼兒腦膜炎的生物體的基因組序列。2005年他成立了一家Synthetic公司,期望研究出能生產(chǎn)可替代燃料的生命形式。在2007年和2008年入選《時(shí)代》影響世界的100人。
如果實(shí)驗(yàn)室出現(xiàn)了怪物
我們?cè)撛趺崔k?
最新一期《經(jīng)濟(jì)學(xué)人》封面文章認(rèn)為,生物科學(xué)既能為人類(lèi)造福,也能造孽。在各種科技手段迅猛進(jìn)步之下,合成生物學(xué)(syntheticbiology)會(huì)變得更普及,它也會(huì)成為家庭作坊的活動(dòng)內(nèi)容。人們必須提高警惕,因?yàn)榕c電腦病毒不同的是合成生物物質(zhì)的可怕自我繁衍能力。
在面對(duì)生物科學(xué)進(jìn)步之時(shí),人造生命看起來(lái)更令人驚奇。實(shí)際上,比“創(chuàng)造”一詞更貼切的字眼是“干預(yù)”。不少人質(zhì)疑科學(xué)家究竟是否能掌控這門(mén)科學(xué),有誰(shuí)能保證它會(huì)被理性地應(yīng)用,從實(shí)驗(yàn)室中會(huì)不會(huì)演變出可怕的怪物。
由于人類(lèi)染色體組項(xiàng)目的完成,分析生命的DNA序列速度極大地提高,分析成本迅速下降。以往需要數(shù)年并花費(fèi)數(shù)百萬(wàn)英鎊的工作,現(xiàn)在只需數(shù)天和數(shù)千英鎊便能解決問(wèn)題。當(dāng)今數(shù)據(jù)庫(kù)中存有包括小到細(xì)微細(xì)菌,大到參天林木的各種生物的染色體組。這意味著未來(lái)很快幾乎任何人都能定制DNA,不可避免的是,一些想法可能是邪惡的。創(chuàng)造邪惡生物帶來(lái)的問(wèn)題與槍炮和炸藥不相同,一旦前者出籠便能自我快速繁衍。
截至目前,還無(wú)人了解如何能讓人類(lèi)現(xiàn)有病原體大爆發(fā),以及讓其他動(dòng)物感染并快速跨越物種傳播的辦法。但人類(lèi)最終還是會(huì)找到這種辦法,現(xiàn)在很難了解如何避免這種威脅。然而,合成生物學(xué)界的觀察家們贊同開(kāi)放這門(mén)科學(xué),阻止邪惡者的最好辦法是讓自己一方有更多智者。若病原體能通過(guò)電腦設(shè)計(jì)出來(lái),那么,防治的疫苗同樣也能如法炮制。
當(dāng)然,這個(gè)行當(dāng)要監(jiān)管,特別是需要隨時(shí)保持警惕。密切關(guān)注新疾病很有意義,即使一些疾病看起來(lái)發(fā)生得很自然,對(duì)生物制品需求監(jiān)控的努力還要增強(qiáng)和協(xié)調(diào)。鼓勵(lì)好想法,消除邪念,人們最終能阻止厄運(yùn)發(fā)生。
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