最近,美國(guó)范德堡大學(xué)通過(guò)改進(jìn)目前的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)軟件,設(shè)計(jì)并人工合成了迄今最大的蛋白質(zhì),打破了華盛頓大學(xué)2003年合成的最大蛋白質(zhì)紀(jì)錄。研究人員指出,他們開(kāi)發(fā)的新方法可以設(shè)計(jì)自然界沒(méi)有的而且更大的蛋白質(zhì),比如更有效的抗體和其他有益蛋白。
該蛋白質(zhì)稱為flr,其三維結(jié)構(gòu)中有8個(gè)β鏈,并由8個(gè)α螺旋環(huán)繞,排列成像小桶一樣的六邊形。新設(shè)計(jì)的蛋白質(zhì)氨基酸數(shù)達(dá)到了242個(gè),而此前的最大紀(jì)錄是106個(gè)。
過(guò)去10多年來(lái),研究人員按照相關(guān)的物理化學(xué)規(guī)則,利用蛋白質(zhì)模型軟件找出合適的氨基酸序列,折疊成穩(wěn)定的形狀來(lái)設(shè)計(jì)出許多自然界沒(méi)有的蛋白質(zhì)。但現(xiàn)有軟件可生成上百萬(wàn)個(gè)候選版本,把每種氨基酸放在各個(gè)位置上測(cè)試其穩(wěn)定性需要占用大量機(jī)時(shí),而且隨著蛋白質(zhì)長(zhǎng)度增加,所需時(shí)間會(huì)急劇增長(zhǎng)。
范德堡大學(xué)化學(xué)副教授詹斯?梅勒領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)對(duì)現(xiàn)有的蛋白質(zhì)工程平臺(tái)rosetta加以改進(jìn),在設(shè)計(jì)過(guò)程中加上了對(duì)稱性。他們使用范德堡先進(jìn)計(jì)算機(jī)研究教育中心的超級(jí)計(jì)算機(jī),花了連續(xù)10天時(shí)間,進(jìn)行了400個(gè)處理過(guò)程來(lái)找到最穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)。
該研究也為一項(xiàng)有爭(zhēng)議性的蛋白質(zhì)進(jìn)化理論――基因復(fù)制與聚合假說(shuō)提供了新支持。該理論認(rèn)為,小蛋白質(zhì)的優(yōu)勢(shì)是能迅速進(jìn)化以適應(yīng)變化的環(huán)境,而大蛋白質(zhì)能執(zhí)行更復(fù)雜的功能。大自然則整合了這兩種優(yōu)勢(shì),選擇小蛋白質(zhì)與它們的副本相互作用形成更大的二聚體蛋白。一旦找到有用的二聚體,原始編碼基因就會(huì)聚合成新基因,直接產(chǎn)出這種二聚體。進(jìn)一步,二聚體基因再經(jīng)過(guò)自然選擇逐漸改良,變得更加有效或發(fā)展出新的功能。
研究人員還指出,不久前蛋白質(zhì)工程師們?nèi)斯ず铣闪酸槍?duì)hiv病毒的蛋白疫苗,并經(jīng)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證明這是一種很有潛力的治療策略,而新方法有助于這項(xiàng)研究的進(jìn)一步擴(kuò)展。
本文地址:http://www.mcys1996.com/jiankang/249805.html.
聲明: 我們致力于保護(hù)作者版權(quán),注重分享,被刊用文章因無(wú)法核實(shí)真實(shí)出處,未能及時(shí)與作者取得聯(lián)系,或有版權(quán)異議的,請(qǐng)聯(lián)系管理員,我們會(huì)立即處理,本站部分文字與圖片資源來(lái)自于網(wǎng)絡(luò),轉(zhuǎn)載是出于傳遞更多信息之目的,若有來(lái)源標(biāo)注錯(cuò)誤或侵犯了您的合法權(quán)益,請(qǐng)立即通知我們(管理員郵箱:douchuanxin@foxmail.com),情況屬實(shí),我們會(huì)第一時(shí)間予以刪除,并同時(shí)向您表示歉意,謝謝!
上一篇: 多囊做輸卵管造影雙側(cè)通暢