，下面主要列舉幾篇今年剛發(fā)表的研究免疫治療應答的文章思路:

圖7：

第一篇解讀的是發(fā)表在Mol Ther Oncolytics（IF:7.20）雜志上篇名為“Single-cell RNA-sequencing analyses identify heterogeneity of CD8 + T cell subpopulations and novel therapy targets in melanoma”的文章。作者重新分析了已經發(fā)表的黑色素瘤單細胞數據，揭示出來7群CD8 T細胞亞群，這些亞群具有不一樣的特征。此外，作者還鑒定出了3個在衰竭性CD8 T細胞上過表達的基因(PMEL, TYRP1和EDNRB)，它們與患者的不良預后顯著相關。像這種思路，只要有數據都能很容易的復現一篇，至于發(fā)到什么樣的雜志上，就看證實的發(fā)現是否新穎。

圖8：

另一篇發(fā)表在 J Immunother Cancer （IF:13.75）篇名為：CXCL13 shapes immunoactive tumor microenvironment and enhances the efficacy of PD-1 checkpoint blockade in high-grade serous ovarian cancer的文章則是從影響免疫浸潤的趨化因子著手。這個思路主要是對明星分子在不同癌型中的功能進行探索，需要通過實驗來進行功能驗證。因為明星分子被研究的很多了，除非做泛癌分析，否則基本上很難做出太新穎的東西。但是這類實驗設計很簡單，只需要證明某個明星分子在 特定的癌型 中通過何種方式影響免疫治療反應即可。

圖9：

如果覺得明星分子沒有太多研究新意，當然還可以通過各種生信方法篩選出關鍵基因。接下來一篇發(fā)表在 Oncoimmunology （IF:8.11）的篇名為“YKT6, as a potential predictor of prognosis and immunotherapy response for oral squamous cell carcinoma, is related to cell invasion, metastasis, and CD8+ T cell infiltration”的文章就是先通過 WGCNA 的方法篩選出和免疫抑制相關的基因YKT6，進行后續(xù)的分析。對于這種新篩出的之前沒有報道過的基因就比較容易說故事，當然這個思路有一些運氣的成分