全球各種大腦圖譜計(jì)劃正在展開,中國臺灣的計(jì)劃似乎有些小
。當(dāng)?shù)乜茖W(xué)家正在研究果蠅研究人員僅需要一個(gè)計(jì)算機(jī)鼠標(biāo)和一個(gè)網(wǎng)頁瀏覽器就能追蹤單個(gè)細(xì)胞并將其縮放回神經(jīng)束交織的網(wǎng)絡(luò)中
但臺灣新竹清華大學(xué)神經(jīng)學(xué)家Ann-Shyn Chiang說,即便是對于這樣一個(gè)小生物
其他的技術(shù)更加易于處理
所以,在神經(jīng)生物學(xué)的世界里
有多大
這一部分是因?yàn)闊o論是什么物種,大腦都如此巨大
在實(shí)驗(yàn)室中
“我們不再是應(yīng)對百萬字節(jié)
Chiang的果蠅團(tuán)隊(duì)對1兆兆字節(jié)的圖像進(jìn)行了梳理
電生理學(xué)研究在計(jì)算方面也變得更加吃力
劍橋哈佛大學(xué)神經(jīng)學(xué)家Florian Engert說,如果你記錄小鼠大腦神經(jīng)元活動20分鐘
神經(jīng)學(xué)家沒有可以對比的模型
搭建橋梁
過去17年,鹽湖城猶他大學(xué)研究神經(jīng)發(fā)育紊亂的系統(tǒng)神經(jīng)學(xué)家Julie Korenberg和同事一直研究在恒河猴中繪制大腦邊緣系統(tǒng)
Korenberg的團(tuán)隊(duì)正在開發(fā)一個(gè)三維協(xié)調(diào)模型,與恒河猴大腦中各種神經(jīng)成像數(shù)據(jù)相匹配
,這些數(shù)據(jù)包括從整個(gè)大腦MRI連接到單細(xì)胞公焦數(shù)據(jù)以及一些區(qū)域的電子顯微鏡亞細(xì)胞分辨率。他們在建立“一個(gè)讓你在一個(gè)圖像上選擇一個(gè)點(diǎn)并以另一種分辨率來看這個(gè)點(diǎn)的系統(tǒng)”,國立精神衛(wèi)生研究所(NIMH)影響社會行為和社會認(rèn)知項(xiàng)目領(lǐng)頭人Janine Simmons說,該機(jī)構(gòu)為Korenberg的研究提供了部分支持。Simmons說,它有些類似谷歌地球,例如,你可以將焦距從40 ×直接轉(zhuǎn)變?yōu)? ×,但卻不能得到這些變焦尺度之間的層次。利用20×共焦透鏡繪制恒河猴大腦邊緣系統(tǒng)圖像將需要巨大的數(shù)據(jù)集
,每個(gè)動物遠(yuǎn)超過600兆兆字節(jié)。到目前為止,該團(tuán)隊(duì)已經(jīng)收集了約100兆兆字節(jié)的數(shù)據(jù)信息,可以通過30太字節(jié)的本地服務(wù)器與云端儲存連接的聯(lián)網(wǎng)儲存設(shè)備獲取。Korenberg說,研究人員可以用縮小尺寸的數(shù)據(jù)集和一臺性能良好的筆記本電腦解決一些問題然而
文化轉(zhuǎn)變
隨著科學(xué)家將可能的范圍向前推動
但態(tài)度在逐漸轉(zhuǎn)變
,首先是那些針對軟件的,其次是數(shù)據(jù)。傳統(tǒng)上,神經(jīng)成像實(shí)驗(yàn)室會花費(fèi)大量時(shí)間下載和裝載同樣的β測試軟件。“為各種軟件失靈和計(jì)算瓶頸開路,編寫大量累贅的編碼以及進(jìn)行他們自己的數(shù)據(jù)管理解決方案,以處理同樣的問題”。加州大學(xué)戴維斯分校神經(jīng)科學(xué)博士生David Grayson說。更糟糕的是,很多非研究性任務(wù)被委托給學(xué)生、博士后和年輕科學(xué)家。傳統(tǒng)的學(xué)術(shù)模式對此沒有幫助
。研究人員通常會設(shè)置假設(shè),并在其團(tuán)隊(duì)內(nèi)獨(dú)立地考慮自己的想法。在這樣的環(huán)境中,研究并未把人帶到一起,而是將他們分散開來,華盛頓西雅圖艾倫腦科學(xué)研究所的Hongkui Zeng說?div id="4qifd00" class="flower right">在談到大腦研究時(shí)
,“完成”是個(gè)移動性的目標(biāo)大數(shù)據(jù)技術(shù)
,就是從各種類型的數(shù)據(jù)中快速獲得有價(jià)值信息的技術(shù)。大數(shù)據(jù)領(lǐng)域已經(jīng)涌現(xiàn)出了大量新的技術(shù),它們成為大數(shù)據(jù)采集、存儲、處理和呈現(xiàn)的有力武器。中國大數(shù)據(jù)產(chǎn)業(yè)聯(lián)盟發(fā)布的《中國大數(shù)據(jù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展地圖》和《中國大數(shù)據(jù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展白皮書》指出
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