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中科大最新Nature子刊發(fā)現(xiàn)lncRNA新功能

佚名 2024-05-30 20:35:55

2016年10月05日訊 來(lái)自中科大的消息,中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)教授單革課題組發(fā)現(xiàn)并命名了一個(gè)長(zhǎng)鏈非編碼RNA--5S-OT

,并發(fā)現(xiàn)在靈長(zhǎng)類中
,5S-OT RNA獲取了調(diào)控多個(gè)基因可變剪切的新功能
。該研究成果發(fā)表在10月3日出版的《自然-結(jié)構(gòu)和分子生物學(xué)》上
。論文的共同第一作者為課題組的博士生胡珊珊和碩士生王小林

從酵母到人類的各種真核細(xì)胞中

,基因組DNA上的信息主要是由RNA聚合酶II及RNA聚合酶III讀取并轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生相應(yīng)的RNA
。這些RNA按照其是否會(huì)作為蛋白質(zhì)翻譯的模板,可以分為編碼RNA(mRNA
,即信使RNA)和非編碼RNA
。非編碼RNA是一大類不編碼蛋白質(zhì)而在細(xì)胞中起著調(diào)控作用的RNA分子。而mRNA往往以大的pre-mRNA前體方式產(chǎn)生并隨后進(jìn)行剪切
,產(chǎn)生能真正作為翻譯蛋白質(zhì)的mRNA模板

研究人員發(fā)現(xiàn)

,在高級(jí)靈長(zhǎng)類和人類當(dāng)中
,5S-OT RNA獲取了調(diào)控多個(gè)基因可變剪切的新功能。在高級(jí)靈長(zhǎng)類和人類中
,5S-OT中插入了一個(gè)反義Alu序列
,并因此同時(shí)產(chǎn)生了一個(gè)多嘧啶(polypyrimidine-tract,Py)位點(diǎn)
。Alu是一種靈長(zhǎng)類特異的基因組短重復(fù)序列
,而人類基因組DNA中約10%的序列為Alu的正向或反向序列。隨后在人細(xì)胞中的研究發(fā)現(xiàn)
,人類5S-OT RNA可以通過(guò)其Py位點(diǎn)招募參與pre-mRNA剪切的蛋白質(zhì)U2AF65
,進(jìn)而通過(guò)5S-OT RNA中的反向Alu序列與靶標(biāo)pre-mRNA當(dāng)中的正向Alu序列的互補(bǔ)配對(duì),將U2AF65蛋白帶到受其調(diào)控的pre-mRNA上
。非靈長(zhǎng)類動(dòng)物的5S-OT RNA不具有Py位點(diǎn)
,不與U2AF65蛋白有相互作用,因而不參與調(diào)控相應(yīng)物種中的mRNA可變剪切

人們可以利用人類5S-OT RNA的這一調(diào)控機(jī)理

,通過(guò)人工設(shè)計(jì)的、針對(duì)特定基因序列的“改裝版”5S-OT來(lái)調(diào)控特定基因的剪切
。很多人類疾病與基因剪切異常相關(guān)
,未來(lái)有可能以這一發(fā)現(xiàn)為基礎(chǔ)發(fā)展出生物技術(shù)來(lái)“糾正”基因的可變剪切

5S-OT RNA在從裂殖酵母到哺乳動(dòng)物(包括小鼠、靈長(zhǎng)類和人)細(xì)胞中均由RNA聚合酶II (Pol II)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生

,并且在其產(chǎn)生處原位介導(dǎo)RNA聚合酶II 和RNA聚合酶III(Pol III)轉(zhuǎn)錄活性的協(xié)同
。在高級(jí)靈長(zhǎng)類及人細(xì)胞當(dāng)中,5S-OT RNA進(jìn)化出調(diào)控細(xì)胞核內(nèi)一些基因剪切(即外顯子Exon間的拼接)的功能
。5S-OT RNA(照片中紅色)定位于小鼠及人細(xì)胞核內(nèi)(照片中藍(lán)色)

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