2016年09月24日訊 《Genome Biology》報(bào)道了一種基于SGN的基因編輯新技術(shù),以結(jié)構(gòu)引導(dǎo)的內(nèi)切酶(SGN,Structure-guided nuclease)實(shí)現(xiàn)體內(nèi)外DNA任意序列的靶向和切割。論文一作為Shu Xu,論文通信作者為南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬金陵醫(yī)院的周國華(Guohua Zhou)研究員、南京大學(xué)模式動(dòng)物研究所的趙慶順(Qingshun Zhao)教授和朱敏生(Minsheng Zhu)教授。做為基因編輯領(lǐng)域的從業(yè)者,讀后很有感觸,應(yīng)BioArt主編之邀請(qǐng),以半學(xué)術(shù)的方式、以隨筆的形式寫出,與各位分享,不嚴(yán)謹(jǐn)之處請(qǐng)大家各自消毒。
感觸之一:構(gòu)思巧妙,略有瑕疵,瑕不掩瑜。
論文中,作者巧妙地融合FEN1(Flap endonuclease-1,是一種可以特異性識(shí)別flap結(jié)構(gòu)的核酸內(nèi)切酶,參與DNA的復(fù)制,修復(fù)和重組過程;除此之外它還具有雙鏈DNA特異的5‘-3’的核酸外切酶活性)和已經(jīng)被成功用于ZFN和TALEN的DNA剪切結(jié)構(gòu)域Fok I,結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)化的linker(GS repeats),設(shè)計(jì)了一個(gè)chimeric protein,實(shí)現(xiàn)了可編程的基因編輯系統(tǒng),具有以下特點(diǎn):短鏈ssDNA導(dǎo)向的基因組特定位置;編輯結(jié)果是產(chǎn)生大片段的deletion(可以大于2.6kb);可以在斑馬魚胚胎中成功編輯內(nèi)源基因。這個(gè)構(gòu)思,看得出包含ZNF以及TALEN的影子,其實(shí)這三者設(shè)計(jì)思路是一致的,其創(chuàng)新點(diǎn)在于靶向元件的選擇十分巧妙,切割元件直接me too。令人驚喜的是,這種原創(chuàng)性工作出自我們中國科學(xué)家團(tuán)隊(duì),略有遺憾的是,論文中體內(nèi)靶點(diǎn)做的偏少,也沒有以CRISPR或者TALEN為對(duì)照,導(dǎo)致尚不能夠評(píng)估其相對(duì)低的編輯效率是來自位點(diǎn)特異性障礙還是來自技術(shù)本身(znf703基因編輯效率1/96≈1%;cyp26b1基因編輯效率是3/29≈10%、這個(gè)位點(diǎn)還真不低)。另外一點(diǎn),如果SGN系統(tǒng)編輯結(jié)果是產(chǎn)生大片段的deletion,那么后期的同源重組做起來要相對(duì)困難(冒昧的揣測(cè)一下:FEN-1外切酶活性是否可以dead?貌似大片段的deletion應(yīng)該是5'-3'的核酸外切酶活性引起的)。
感觸之二:表述質(zhì)樸謙遜,留下很大的優(yōu)化空間。
通篇論文讀下來,科學(xué)之外,還感覺到一種相對(duì)質(zhì)樸的文風(fēng),措辭之間充盈著謙遜。這么講,可能超出了學(xué)術(shù)范疇,所以稱之為隨筆,既然自己給自己開了這么一個(gè)后門,所以,干脆就談出來,好在筆者與南京大學(xué)與作者沒有關(guān)聯(lián),也就沒有了套磁之嫌疑。例如,在基本術(shù)語上作者沒有跟風(fēng):“SGN”而不是“ssDNA guided Nuclease”,“DNA editing”而不是“genome editing”,這些細(xì)節(jié)都能夠體現(xiàn)出一種“獨(dú)立性”?;蚓庉嫾夹g(shù)的效率是極其重要的,目前看在這篇論文中,作者沒有更多地報(bào)道相關(guān)的條件優(yōu)化工作,例如效率瓶頸是存在于guide DNA與靶向區(qū)域的結(jié)合效率?還是存在于SGN的識(shí)別效率?整個(gè)生物學(xué)場(chǎng)景之中,目標(biāo)區(qū)域的DNA melting究竟有多重要?是轉(zhuǎn)錄相關(guān)事件還是復(fù)制相關(guān)事件?(冒昧的揣測(cè)一下:是不是質(zhì)粒編輯實(shí)驗(yàn)中采用可誘導(dǎo)啟動(dòng)子即可幫助判斷?)當(dāng)然,不應(yīng)該要求一篇論文解決和回答這么多的科學(xué)或技術(shù)問題,但是可以預(yù)計(jì),這個(gè)新工具可能還有較大優(yōu)化空間,期待著他們更多的進(jìn)一步報(bào)道。
感觸之三:就是要挑戰(zhàn)CRISPR,盡管它似乎難以逾越!
眾所周知,今年5月2日《Nature Biotechnology》在線發(fā)表河北科技大學(xué)韓春雨博士“一鳴驚人”的論文,報(bào)告了一種NgAgo-gDNA基因編輯新工具,盡管因不可重復(fù)而使韓春雨“一波三折”地陷入學(xué)術(shù)誠信危機(jī),但是,此文也算是高調(diào)地揭開了挑戰(zhàn)CRISPR暗中競(jìng)賽的蓋子。盡管CRISPR如日中天,甚至有“l(fā)ong live CRISPR”之類的戲言,但是,CRISPR并不完美,這種“不完美”不僅僅來自O(shè)ff-target、PAM的限制性、難以實(shí)現(xiàn)單堿基精確編輯之類的技術(shù)瑕疵,更是來自人類對(duì)新技術(shù)的“天然貪婪”,來自根深蒂固的奧林匹克精神“更快、更高、更遠(yuǎn)”,來自我們骨子里的征服欲。正如哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)教授George Church所言:新技術(shù)都是脆弱的,隨時(shí)可能被取代;加州大學(xué)圣迭戈分校的Prashant Mali 說的更直白“我們需要的不止這些”。所以,從技術(shù)使用者的角度看,CRISPR是大自然和幾位先鋒科學(xué)家送來的珍貴禮物,在欣然擁抱它的同時(shí)、當(dāng)然也期待著更好的技術(shù)出現(xiàn);從技術(shù)開發(fā)者的角度看,大紅大紫般火熱的CRISPR又是新的競(jìng)賽標(biāo)桿,它令人嫉妒地、高傲地立在那里,挑逗和激發(fā)著人們超越它的沖動(dòng)。
感觸之四:源自天然、超越天然,從基因編輯技術(shù)演化史看“工程化”在技術(shù)工具開發(fā)中的重要性。
有人把基因編輯技術(shù)做了“斷代工程”,給技術(shù)劃代,很形象、也利于普及,但是有時(shí)候也比較困難。一般地,理論上可以在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中近乎任意位點(diǎn)切割并引發(fā)編輯的ZFN、TALEN以及CRISPR,它們?cè)跁r(shí)間節(jié)點(diǎn)上依次出現(xiàn)、而且效率和便利性也越來越好,所以被稱為第一代、第二代、第三代基因編輯技術(shù)(1G、2G、3G)。筆者愿意把他們稱之為大眾基因編輯工具,因?yàn)閷?duì)應(yīng)著的還有一些小眾工具,鑒于其自身的技術(shù)局限和缺陷,并沒有被大家普遍接受。今天,先聊一聊大眾工具,隨后加一些小花邊,再聊聊那些正在被淘汰和被遺忘的小眾工具,補(bǔ)充這些小眾工具的演化史,可以更加清晰地看出技術(shù)發(fā)展脈絡(luò),或許從中獲得另外的靈感和啟發(fā)。
從大眾工具看,“工程化”貫穿始終?,F(xiàn)代中文語境中,一直有一種混淆科學(xué)與技術(shù)的“語義學(xué)”困境??茖W(xué)與技術(shù)相關(guān)但不相同,有人形象地這樣區(qū)分科學(xué)與技術(shù):know what,know why是科學(xué),know how是技術(shù)?;蚓庉嬁傮w上是一種技術(shù),其相關(guān)工具的開發(fā),起步于科學(xué)發(fā)現(xiàn),但是不止步于科學(xué)發(fā)現(xiàn)。例如,從現(xiàn)有公開文獻(xiàn)看,CRISPR最重要的科學(xué)發(fā)現(xiàn)節(jié)點(diǎn)是2011年卡彭蒂艾(Emmanuelle Charpentier)對(duì)tracrRNA的生物學(xué)功能的闡明。但是,有時(shí)候,造物主很懶,他開辟了這個(gè)世界之隨后可能置之不理了。所以,大自然留給我們的禮物,有時(shí)候配不上我們征服的野心,因此,就人類目標(biāo)而言,我們從來都不吝嗇和遲疑于改進(jìn)和再造。果然,隨后的2012年,卡彭蒂艾就會(huì)同詹妮弗·刀娜(Jennifer A. Doudna)聯(lián)合發(fā)表了劃時(shí)代論文,把tracrRNA和guide RNA合二為一,做成了工程化的“chimeric single guide”,sgRNA由此誕生。而在CRISPR-Cas工程化、模塊化方面貢獻(xiàn)最大的,應(yīng)該首推華人科學(xué)家張鋒教授。除CRISPRi、 CRISPRa之外,早在2013年的綜述中,張鋒教授就展望了包括把Cas設(shè)計(jì)為光控模式在內(nèi)的各類工程化方案。而就是在本月,又推出了兩項(xiàng)以遙控sgRNA的方式對(duì)CRISPR實(shí)施即時(shí)控制的技術(shù)方案。哈佛和神戶大學(xué)的團(tuán)隊(duì)先后發(fā)表了利用“工程化”措施將AID與dCas9做成chimeric protein實(shí)現(xiàn)了不依賴于同源重組的單堿基編輯。就在本月初,MIT的團(tuán)隊(duì)創(chuàng)建了光敏感的sgRNA技術(shù);幾乎與此同時(shí),深圳的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)報(bào)告了“化學(xué)控制”的sgRNA的控制技術(shù)。
讓我們把視野再回望到ZFN和TALEN,更是工程化的杰出案例,直至今天討論的SGN,其“動(dòng)作模塊”甚至“毫不動(dòng)搖”地使用FokⅠ,所變換進(jìn)化的是“GPS定位模塊”。這堪稱技術(shù)演化之中還留下了歷史痕跡,好似“保守序列”一樣,讓人驚嘆“自然進(jìn)化”與“人工進(jìn)化”異曲同工之奇妙。
所以,基因編輯工具開發(fā)工程化的基本方程式是:GPS定位模塊+執(zhí)行模塊。話分兩頭說。
先聊“執(zhí)行模塊”。FokⅠ屢戰(zhàn)屢勝,但是,一定還有其它選擇,畢竟,造物主應(yīng)該是慷慨的,地球生命演化了四十億年,留下的自然遺產(chǎn)極為豐富。
再聊聊GPS定位模塊。這個(gè)模塊工作效率及操作便利性如何,是基因編輯工具“好不好使”的關(guān)鍵。ZFN和TALEN的主要特點(diǎn)是:以蛋白質(zhì)特定結(jié)構(gòu)域來完成靶向定位,其主要缺陷是:定位模塊體外準(zhǔn)備麻煩,工作量大成本高;相比之下,CRISPR-Cas卻方便的多,所以在總體競(jìng)爭中勝出。但是CRISPR-Cas還是或多或少存在Off-target的弊端,為了解決這個(gè)問題、進(jìn)一步強(qiáng)化定位精準(zhǔn)性,已有報(bào)道以dcas9為定位器,融合上FokⅠ,實(shí)現(xiàn)正義鏈和反義鏈雙向定位、并形成FokⅠ二聚體造成DNA雙鏈斷裂(DSB)、引發(fā)編輯。本次討論的南京大學(xué)的這篇文章,再一次創(chuàng)新了GPS定位模塊,首次采用FEN-1(flap endonuclease-1)來執(zhí)行定位功能,將定位指令轉(zhuǎn)化為方便人工編程的guide-ssDNA,做的很巧妙。
聊到這里,下一個(gè)創(chuàng)新近似于呼之欲出:盡管NgAgo似乎失敗了,但是它工程化改造的前景呢?pAgo做為基因組“GPS定位模塊”的可能性,怎能不令工具開發(fā)者怦然心動(dòng),就連我那個(gè)簡陋的實(shí)驗(yàn)室,都已經(jīng)于幾個(gè)月前就開始努力了,萬一大牛們漏掉了某些創(chuàng)意呢?
總之,GPS定位模塊+執(zhí)行模塊=基因編輯工具,兩個(gè)模塊的重點(diǎn)是定位模塊。設(shè)計(jì)靈感源自天然存在的自然遺產(chǎn)、但不止步于天然存在。自然界留給我們很多的提示和啟發(fā),例如:位點(diǎn)特異重組酶(site specific recombinase)如何?整合酶(integrases)如何?轉(zhuǎn)座酶(transpotase)如何?其它未知的recombinase如何?這個(gè)領(lǐng)域的干法和濕法挖掘競(jìng)賽應(yīng)該一直在進(jìn)行。張鋒曾說到:“通過對(duì)多種酶進(jìn)行探索,我們可以得到一個(gè)更強(qiáng)的基因組編輯工具箱。我們必須繼續(xù)探索未知。”
最后的花邊:從G0談起,回顧一下“淪落”為小眾的基因編輯工具。
上世紀(jì)七十年代末,利用限制性內(nèi)切酶實(shí)現(xiàn)了質(zhì)粒體外重組,標(biāo)志著第一代基因工程的誕生。隨后,基于同源重組的體內(nèi)染色體水平的基因工程成為現(xiàn)實(shí),但是由于重組率極低,必須使用抗生素抗性或營養(yǎng)缺陷等標(biāo)記加以篩選,做不到無痕編輯。之后,盡管發(fā)展了反向篩選標(biāo)記、cre位點(diǎn)預(yù)埋及抗性回收等技術(shù)措施,但是,還是繁瑣和低效。業(yè)界對(duì)無標(biāo)記的無痕基因編輯技術(shù)是十分期待的,無標(biāo)記無痕的關(guān)鍵在于編輯效率,只要效率達(dá)到百分之一以上的數(shù)量級(jí)別,就有希望。這里讓我們一起回顧一下兩個(gè)小眾工具,作為“綠葉”來襯托一下廣為人知的大眾工具。
其一,G0代的重組工程(Recombineering)。上世紀(jì)90年代末,基于λ噬菌體的Red重組酶的重組工程(Recombineering)出現(xiàn)了,這個(gè)領(lǐng)域中,中國科學(xué)家于代冠(Daiguan Yu)跟隨NIH的Donald L . Curt,做出了不少貢獻(xiàn),于代冠博士后來回到了中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院?;赗ed系統(tǒng),哈佛大學(xué)George Church于2008年在《Nature Biotechnology》上發(fā)表了改進(jìn)版的MAGE,可以自動(dòng)化地在數(shù)天內(nèi)引發(fā)十億計(jì)的突變;至2013年,Church又把基于ss-oligo的的重組工程從大腸桿菌擴(kuò)展到釀酒酵母,這個(gè)過程還與rad51/rad54相關(guān),被Church發(fā)展成YOGE技術(shù),之所以特別強(qiáng)調(diào)Church,是因?yàn)檫@位偉大的科學(xué)家也是早期CRISPR的推進(jìn)者之一,他采用Cas9編輯高等細(xì)胞基因組的論文,與張鋒“同框”于2013年1月的Science。但是,重組工程最終沒有能夠再擴(kuò)展到其它物種,特別是沒有實(shí)現(xiàn)哺乳動(dòng)物細(xì)胞的基因編輯。大腸桿菌的Red/ET系統(tǒng),也是重組工程的重要實(shí)現(xiàn)工具,也是目前仍在普遍使用的分子生物學(xué)基本操作工具,這個(gè)系統(tǒng)源自中國科學(xué)家張友明在歐洲留學(xué)工作期間做出的開創(chuàng)性工作,張友明博士后來回到山東大學(xué)工作。總體上,基于寡核苷酸入侵的重組工程可擴(kuò)展性不夠好(局限于原核的細(xì)菌、真核最多跨到釀酒酵母),效率相對(duì)低下(在千分之一到百分之一之間),難以大幅度優(yōu)化。
其二,G2.5代的Targetron。這個(gè)來自原核微生物防御機(jī)制的Targetron技術(shù),筆者更愿意把它稱之為2.5代技術(shù),不是因?yàn)樗男剩且驗(yàn)樗腉PS定位模塊的工作方式,其方式是結(jié)合了“個(gè)別DNA位點(diǎn)的蛋白質(zhì)識(shí)別”和“其它位點(diǎn)的RNA識(shí)別”,而且識(shí)別序列是可編輯的、可以“reprogrammable”的。這個(gè)編輯工具的大本營首推德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校,他們有對(duì)外開放的設(shè)計(jì)軟件及一些技術(shù)服務(wù),但是,它編輯復(fù)雜、使用困難、物種可擴(kuò)展性不高,梭狀芽孢桿菌是可以用的,中科院微生物所李寅組和上海的楊晟組都有相關(guān)工作??傊匀皇且粋€(gè)小眾工具。
SGN將會(huì)如何?是小眾工具還是能夠發(fā)展成大眾工具呢?pAgo能不能進(jìn)一步W為NgAgo“正名”?能不能正名之后再發(fā)展成大眾工具呢?前提是solid、可重復(fù),并且用戶友好。讓我們拭目以待吧!
源于天然而超越天然,正道也!再次祝賀南京大學(xué)科學(xué)家在基因編輯領(lǐng)域的這項(xiàng)重大突破!
自2016年5月2日韓春雨作為通訊作者的“基因編輯技術(shù)NgAgo”論文發(fā)表引起關(guān)注、5月底質(zhì)疑的聲音開始出現(xiàn),韓春雨實(shí)驗(yàn)的可重復(fù)爭議,不僅科學(xué)界議論紛紛,在社會(huì)層面也引發(fā)了相關(guān)討論。那么,基因編輯技術(shù)到底是一項(xiàng)怎么樣的技術(shù)呢?為什么它這樣備受矚目?今天我們就一起去扒一扒基因編輯技術(shù)的“真面目”!
(圖片來自網(wǎng)絡(luò))
基因編輯技術(shù)到底是個(gè)什么鬼?
首先我們先介紹一下基因編輯的概念。實(shí)際上,“基因編輯”這四個(gè)字是比較簡化的,嚴(yán)格來說我們應(yīng)該稱它為“基因組定點(diǎn)編輯技術(shù)”。這里我們要注意兩個(gè)關(guān)鍵詞,一個(gè)是“基因組”,它要在細(xì)胞核的基因組里面。
另一個(gè)是“定點(diǎn)編輯”,因?yàn)樵诩?xì)胞核的基因組里面,不同的基因都有不同的位點(diǎn)。如果我們不是說在特定的基因組位點(diǎn)進(jìn)行編輯的話,實(shí)際上和我們現(xiàn)在討論的這個(gè)技術(shù)就大相徑庭了。因?yàn)橛泻芏嗥渌夹g(shù)可以改變細(xì)胞內(nèi)的DNA組成。比如線粒體基因替代技術(shù)。還有一個(gè)就是用重組過的特異性病毒引入外源基因,但是它不能夠定點(diǎn),它是隨機(jī)放到基因組里面的,這和我們今天要討論的基因編輯技術(shù)都是不一樣的。基因編輯技術(shù),也就是“基因組定點(diǎn)編輯技術(shù)”,這個(gè)技術(shù)指的是對(duì)特定DNA片段的敲除、加入以及定點(diǎn)突變。
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基因編輯技術(shù)的歷史
實(shí)際上,基因編輯技術(shù)不是一個(gè)新的概念,早在90年代就開始有了。到目前為止,已經(jīng)經(jīng)歷了三代。
第一代基因編輯技術(shù)就是同源重組建立動(dòng)物基因敲除(knock-out),基因敲入(knock-in)的基因突變模型。顧名思義,基因敲除(knock-out)指的是把原有的動(dòng)物基因組的某些基因通過一定的技術(shù)把它從動(dòng)物基因組里敲除出去;基因敲入(knock-in)則是在動(dòng)物基因組某個(gè)位點(diǎn)上把原本不存在的基因通過一定的技術(shù)把它整合進(jìn)去。基因敲除(knock-out)和基因敲入(knock-in)是通過DNA同源重組技術(shù)來完成的。這是一個(gè)非常復(fù)雜的技術(shù)。如果要做成一個(gè)成功的動(dòng)物基因敲除(knock-out),基因敲入(knock-in)的基因突變模型,大概需要花費(fèi)2到3年的時(shí)間,投入的資金也比較多。另外,這個(gè)技術(shù)一般來說是用于建立遺傳疾病研究的動(dòng)物模型,很難用于臨床或者說大面積應(yīng)用在農(nóng)業(yè)畜牧業(yè)方面。
第二代基因編輯技術(shù)是ZFN,TALEN技術(shù)。這兩個(gè)技術(shù)的原理都是通過DNA核酸結(jié)合蛋白和核酸內(nèi)切酶結(jié)合在一起建立一個(gè)系統(tǒng)。因?yàn)檫@些蛋白可以識(shí)別一定的核苷酸序列,通過一定設(shè)計(jì)形成的系統(tǒng)可以對(duì)特定的基因進(jìn)行基因敲除和基因突變。
第三代基因編輯技術(shù)就是最近非?;鸬腃RISPR/Cas9 系統(tǒng)。它的原理就是利用核糖體結(jié)構(gòu)來進(jìn)行基因編輯。CRISPR/Cas9 系統(tǒng)經(jīng)過一定的設(shè)計(jì)可以結(jié)合到靶基因上,然后對(duì)這個(gè)靶基因進(jìn)行敲除、定點(diǎn)突變或者引入新的外源基因,來進(jìn)行基因編輯。
(圖片來自網(wǎng)絡(luò))
為什么第三代基因編輯技術(shù)備受矚目?
確切地說,這三代基因編輯技術(shù)到目前為止都存在一定的技術(shù)局限性。第一個(gè)比較明顯的局限性就是脫靶效應(yīng)。那什么是脫靶效應(yīng)呢?比如原本設(shè)計(jì)是對(duì)某一個(gè)DNA靶點(diǎn)進(jìn)行基因編輯,但是一直找一直找,卻沒有找到正確的靶點(diǎn),實(shí)際上卻跑到這個(gè)點(diǎn)組成相似的位點(diǎn)去了,這就出現(xiàn)了脫靶。
成功讓雄性老鼠體細(xì)胞變成卵細(xì)胞
當(dāng)?shù)貢r(shí)間3月8日,在英國倫敦召開的第三屆人類基因組編輯國際峰會(huì)上,來自日本九州大學(xué)的林克彥(Katsuhiko Hayashi,音譯)教授介紹了該研究的詳細(xì)情況。
該技術(shù)包括首先從雄性老鼠身上提取皮膚細(xì)胞,然后將其轉(zhuǎn)化成類似干細(xì)胞的狀態(tài),以創(chuàng)建所謂的誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞(iPS cells)——一種可以轉(zhuǎn)化為其他類型細(xì)胞的細(xì)胞。因?yàn)樵撈つw細(xì)胞從雄性老鼠身上提取,因此具有XY染色體。林克彥教授的團(tuán)隊(duì)剔除了其中的Y染色體,再向另一個(gè)細(xì)胞“借來”一個(gè)X染色體,然后將兩個(gè)X染色體巧妙地“粘”在一起。這一流程使得干細(xì)胞變成卵細(xì)胞。
“這其中最大的訣竅就是X染色體的復(fù)制。”林克彥教授說,“我們真的試圖建立一個(gè)系統(tǒng)來復(fù)制X染色體?!?br>最后,擁有兩個(gè)X染色體的這些細(xì)胞被放置在一個(gè)卵巢類器官中進(jìn)行培養(yǎng),從而形成卵子。當(dāng)與正常精子受精后,科學(xué)家們獲得了大約600個(gè)胚胎,并將其植入代孕老鼠體內(nèi)。最終,代孕老鼠誕生了7只小鼠幼崽。
這些小老鼠看起來很健康,會(huì)有一個(gè)正常的壽命,并在成年后得以繼續(xù)生育后代?!八鼈兛雌饋磉€不錯(cuò),在正常生長,以后能夠成為父親?!绷挚藦┙淌诒硎尽?shí)驗(yàn)中約1%的生產(chǎn)成功率低于用正常女性卵細(xì)胞能夠達(dá)到的5%的成功率。
不孕不育癥患者的新希望?
現(xiàn)階段該技術(shù)還不能安全用于人類
林克彥教授表示,該研究的主要?jiǎng)訖C(jī)是希望能夠?yàn)轭净疾辉胁挥Y的夫妻提供一種生育治療方法,例如患有特納綜合征的婦女,她們拷貝的X染色體有一整個(gè)或部分缺失的情況。
他繼續(xù)補(bǔ)充,目前,這項(xiàng)研究仍處于早期階段,卵細(xì)胞的質(zhì)量不高?!凹词乖诶鲜笊砩蠈?shí)驗(yàn),卵細(xì)胞的質(zhì)量也存在很多問題。因此,在考慮將其作為一種生育治療方法之前,我們必須克服這些問題,這可能需要很長的時(shí)間?!彼硎尽?br>同時(shí),在這個(gè)階段,技術(shù)還不能安全地用于人類。但是,他認(rèn)為這一問題能夠在10年內(nèi)得到解決。然而,部分科學(xué)家認(rèn)為這一時(shí)間估計(jì)過于樂觀,因?yàn)槟壳霸趯?shí)驗(yàn)室條件下還未能從女性細(xì)胞中創(chuàng)造出可行的人類卵細(xì)胞。并且,也有科學(xué)家提出,人類的細(xì)胞需要更長的培養(yǎng)時(shí)間來產(chǎn)生一個(gè)成熟的卵細(xì)胞,這可能會(huì)增加細(xì)胞獲得不必要的遺傳變化的風(fēng)險(xiǎn)。
此外,林克彥教授還提出對(duì)社會(huì)是否能夠接受這一技術(shù)的擔(dān)憂。他并不贊同男性用自己的精子和人工制造的卵細(xì)胞來創(chuàng)造一個(gè)嬰兒?!霸诩夹g(shù)上這是可能的。但是我不太確定在現(xiàn)在這個(gè)階段,它是否安全或?yàn)樯鐣?huì)所接受?!彼a(bǔ)充到。林克彥教授已經(jīng)向科學(xué)雜志《自然》提交了這一研究。
中國科學(xué)院的王浩義教授認(rèn)為,在考慮將該技術(shù)應(yīng)用于臨床之前,還有很長的路要走。“科學(xué)家從不說永遠(yuǎn),原則上,實(shí)驗(yàn)已經(jīng)在老鼠身上完成了,當(dāng)然它可能在人類身上實(shí)現(xiàn)。但我可以預(yù)見到未來(該技術(shù))會(huì)遇到很多挑戰(zhàn),我無法預(yù)測(cè)(克服它們)將花費(fèi)多少年?!?br>紅星新聞?dòng)浾?王雅林 實(shí)習(xí)生 王慕寧
NgAgo-gDNA技術(shù)是以DNA作為引導(dǎo)工具的基因編輯技術(shù)。NgAgo-gDNA技術(shù)的工作原理與CRISPR-Cas9技術(shù)有些類似,都是在引導(dǎo)工具的引導(dǎo)下,令核酸酶對(duì)特定位點(diǎn)的基因序列進(jìn)行切割,從而進(jìn)行基因編輯。不同的是NgAgo-gDNA技術(shù)中所用到的引導(dǎo)工具是一段引導(dǎo)DNA(gDNA)而不是CRISPR-Cas9技術(shù)中的RNA。由于也不需要通過蛋白(如鋅指蛋白)來尋找需要替換的序列,因此,NgAgo-gDNA技術(shù)與CRISPR-Cas9技術(shù)一樣,較之前的基因編輯技術(shù),在操作上要簡單方便得多,利于其在應(yīng)用中的推廣。
NgAgo-gDNA技術(shù)所用的核酸酶是NgAgo,一種存在于格氏嗜鹽堿桿菌(Natronobacteriumgregoryi)中的Ago內(nèi)切核酸酶蛋白。Ago核酸酶最初是由荷蘭科學(xué)家發(fā)現(xiàn)其可以有效地利用單鏈DNA作為短介質(zhì),去相對(duì)精準(zhǔn)地切割基因組靶點(diǎn)。而最初的研究的局限性在于實(shí)驗(yàn)所需要的溫度在65-75攝氏度,不能在生理?xiàng)l件下完成。而通過韓春雨教授團(tuán)隊(duì)的不斷搜尋,最終他們發(fā)現(xiàn)來自于格氏嗜鹽堿桿菌的Ago同源蛋白可以在生理?xiàng)l件下實(shí)現(xiàn)類似的功能。
NgAgo-gDNA技術(shù)可能比CRISPR-Cas9技術(shù)擁有更多優(yōu)勢(shì),與CRISPR-Cas9技術(shù)相比,NgAgo-gDNA技術(shù)可編輯的靶位點(diǎn)的選擇范圍更大。因?yàn)镃as9需要與基因組上19個(gè)堿基配對(duì),并要求在這組堿基后緊鄰一個(gè)特定的三堿基序列(PAM序列),一定程度上限制了靶位點(diǎn)的選擇范圍,而NgAgo-gDNA技術(shù)中靶位點(diǎn)的選擇則不受PAM序列的限制,編輯對(duì)象所受限制更小,幾乎能編輯基因組內(nèi)任何位置。
另外,與NgAgo結(jié)合的gDNA長度為24個(gè)堿基,這比與Cas9結(jié)合的19個(gè)堿基的gRNA要長5個(gè)堿基,理論上其精確性要提高1024(4的5次方)倍。并且韓春雨團(tuán)隊(duì)的研究還發(fā)現(xiàn),與CRISPR-Cas9相比,NgAgo–gDNA系統(tǒng)對(duì)向?qū)蛄?靶序列錯(cuò)配容忍度很低。編輯精準(zhǔn)度更高,能更有效地避免脫靶現(xiàn)象。
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