2016年09月12日訊 蘭尼堿受體(Ryanodine Receptors)是內(nèi)質網(wǎng)和肌質網(wǎng)(Sarcoplasmic Reticulum)釋放鈣離子的大型離子通道,這個過程是肌肉收縮的先決條件。近期冷凍電子顯微鏡提供的數(shù)據(jù)幫助科學家們直接觀察到了這些巨大膜蛋白的變構運動。
9月Cell Research雜志封面公布了北京大學基礎醫(yī)學院尹長城(Chang-Cheng Yin)教授和中科院生物物理研究所孫飛(Fei Sun)研究員合作的最新成果:利用冷凍電鏡獲得了鈣離子激活的RyR1開放態(tài)結構,總體分辨率達到4.9,核心區(qū)域分辨率達到4.2,并通過比對關閉和開放狀態(tài)下的區(qū)別,揭示了鈣離子如何通過長程變構“激活”RyR1的機制。
同期Cell Research雜志也邀請了國際RyR領域結構生物學專家Filip Van Petegem發(fā)表評述文章“How to open a Ryanodine Receptor”。Van Petegem教授曾在2010年詳細描述了RyR1一個熱區(qū)的結構,并對突變引起受體失常,快速釋放鈣離子的機制進行了推測。
人類基因組編碼三種RyRs亞型,相對分子量均超過2.2 MDa,由超過5000個氨基酸的殘基單體聚合形成。RyR1是原發(fā)骨骼肌亞型,其上百種突變與肌中央軸空?。╟entral core disease,CCD),以及惡性高熱(Malignant hyperthermia,MH)病相關。RyR2主要出現(xiàn)在心臟中,與壓力誘導的心律不齊有關。
由于RyRs通道龐大,因此一直被認為是冷凍電鏡cryo-EM研究的理想材料。并且隨著這一技術的不斷進步,科學家獲得了分辨率為6.1?-3.8關閉狀態(tài)的三種RyR1受體,構建出了70% 的RyR1結構。
從整體上說,RyRs由N末端結構域,SPRY結構域,P1和P2結構域,橋接solenoid以及中央solenoid組成,通道部分則包含S1-S6跨膜段,類電壓感受器,和CTD等亞結構,因此具有6次跨膜電壓門控離子通道超家族的結構特點。RyR是獨特之處在于大型α 螺旋多個部位構成的一個巨大胞漿帽,其中穿插了大量的球狀結構域。
Van Petegem指出,2009年,Samso等人以10 ? 的分辨率比對了開放和關閉狀態(tài)的RyR1,為北大尹教授與同期Cell Research雜志上公布的清華顏寧教授的研究奠定了基礎,這兩個研究組得出了相似的RyR1跨膜區(qū)域中變構結論,也提出了不同的關于胞漿帽作用的觀點。
RyR1受胞漿Ca2+激活打開過程呈鐘形曲線,先是小幅增長促進通道開放,然后大開口打開,引發(fā)抑制作用。清華大學的研究組采用的是50μM Ca2+和 10μM 的PCB95,得到了開放狀態(tài)的RyR1的冷凍電鏡結構,但卻發(fā)現(xiàn)中心區(qū)域卻是關閉的,之前他們又將Tween-20 換成了CHAPS y,得到了5.7 ?的開放RyR1結構。
北京大學的尹教授研究組采取了不同的策略,采用的是100 μM Ca2+ 和一種能進一步穩(wěn)定開放狀態(tài)的封閉劑釕紅。這樣結合之前的開放狀態(tài)結構,和10mM Ca2+濃度下8.5 ?關閉狀態(tài)的結構,進行多個結構的比對。
6次跨膜離子通道都會出現(xiàn)成孔結構域(pore-forming domain)中的開放變構,內(nèi)螺旋S6會在保守的甘氨酸周圍彎曲,引起疏水收縮點附近的孔隙變寬,這樣Ca2+就能滲透進來。這些移動變化直接偶聯(lián)VSL結構域和S6,內(nèi)螺旋也比一般6-TM通道要長,延伸到了能與上游U-motif接觸到的鋅指結構。這就為RyR開放提供了兩條途徑:延伸S6螺旋,配合U-motif,或VSL的移動,尹教授研究組詳細描述了其中的細節(jié)變化,比如選擇性濾器的變寬,S4區(qū)域向lumen的移動。
那么這些變構運動源自哪里呢?尹教授研究組猜測是EF-hand結構域,因為之前曾有報道發(fā)現(xiàn)這一結構域的突變會影響Ca2 + 感應靈敏性。另外近期的研究也表明刪除整個EF-hand結構域,并不會影響RyR2 的Ca2+ 釋放過程,這表明EF-hand亞結構域并不是主要的Ca2+ 感應器。但尹教授研究組發(fā)現(xiàn)在第一個EF-hand中會出現(xiàn)構象變化:其螺旋之間有33度的傾斜變化。
Van Petegem點評道,這些新的研究是解開RyR謎題的一大飛躍,下一步還需要研究其它影響門控的配基和蛋白的復合物結構,其中最令人感興趣的是Cav1.1,即與RyR1有重要關聯(lián)的骨骼肌電壓門控鈣通道。
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