百邁客Nature,Genetics芥菜基因組文章解讀

，發(fā)現(xiàn)dominance的基因被篩選出來(lái)的比例較高，同時(shí)結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，這部分基因在油用和菜用兩個(gè)群體中差異表達(dá)。同時(shí)通過(guò)上面的分析發(fā)現(xiàn)與硫苷，脂類代謝顯著相關(guān)并且存在dominance的基因組，這些基因在油用菜用群體中有各自獨(dú)特基因分型。

四、文章亮點(diǎn)

1. 多倍體復(fù)雜基因組解決方案：二代+三代+光學(xué)

，組裝出高質(zhì)量復(fù)雜基因組；

2. 多個(gè)角度證據(jù)解決芥菜亞基因組A亞基因組單系起源/雜交起源爭(zhēng)論：Asubgenome phylogenetic tree，PCA, polymprphism and fixed SNP

；

3. 通過(guò)構(gòu)建群體模型及貝葉斯方法評(píng)估多倍體芥菜形成時(shí)間上下限

，為新多倍體物種形成時(shí)間估算提供新方法；

4. 從不同發(fā)育時(shí)期

，不同組織，不同處理?xiàng)l件，不同進(jìn)化時(shí)期多個(gè)角度系統(tǒng)分析異源多倍體dominance 現(xiàn)象；

5. 通過(guò)油用菜用群體選擇角度識(shí)別vegetable- and oil- use B. juncea 分化選擇區(qū)域，發(fā)現(xiàn)與硫苷

，脂類代謝顯著相關(guān)并且存在dominance的基因組，這些基因在油用菜用群體中有各自獨(dú)特基因分型；

6. 首次找到dominance gene 與潛在農(nóng)藝性狀選擇相關(guān)性的證據(jù)

，為多倍體物種遺傳育種提供了新的方向和基因候選材料。

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