加拿大麥吉爾大學(xué)的研究人員最近發(fā)現(xiàn)一種可以促使乳腺癌中的腫瘤細(xì)胞生長的基因。這一發(fā)現(xiàn)將為治療乳腺癌創(chuàng)造條件。
參與研究的麥吉爾大學(xué)腫瘤學(xué)家威廉姆·穆勒博士說,這一稱為“BETAL1-INTEGRIN”的基因在胚胎的形成中發(fā)揮著很重要的作用。但對于一部分婦女而言,如果這一基因的活動過于活躍,將會引發(fā)乳腺癌。在實驗中,研究人員在10多只已患有乳腺癌的實驗鼠體中剔除這一基因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)鼠體內(nèi)的腫瘤細(xì)胞生長得到遏制,而實驗鼠的乳腺仍然可以維持正常功能。
此外,研究人員還發(fā)現(xiàn),這一基因?qū)η傲邢佟⒅蹦c和卵巢癌癥等也有間接的誘發(fā)作用。
研究人員根據(jù)這項新成果計劃在今后5年內(nèi)研制治療乳腺癌的藥物。
研究表明:在美國,大約1/8的女性會患上浸潤性乳腺癌,這一數(shù)字大約是美國女性總數(shù)的13%。而男性也未能幸免:大約833人中就有1人被診斷出患有乳腺癌。根據(jù)美國癌癥協(xié)會的論述,乳腺癌最重要的風(fēng)險因素是女性和變老,而我們卻對這兩項風(fēng)險因素?zé)o能為力。因此,雖然預(yù)防是關(guān)鍵,但盡可能多地了解疾病進(jìn)展和治療反應(yīng)是尤為重要的。
從開始梳理腫瘤微環(huán)境的單細(xì)胞基因表達(dá)研究,到基于局部空間基因表達(dá)的腫瘤細(xì)胞類型圖譜——隨著單細(xì)胞和空間技術(shù)的到來,乳腺癌研究領(lǐng)域取得了重大進(jìn)展。
基于激素受體陽性、HER2陽性和三陰性乳腺癌(TNBC)[1]?相關(guān)基因表達(dá),乳腺癌可以細(xì)分為5個分子亞型。然而,相對而言,科學(xué)家們對乳腺癌復(fù)雜的腫瘤微環(huán)境(TME)、腫瘤如何與免疫系統(tǒng)和其他周圍細(xì)胞和組織相互作用以及這種活動對預(yù)后和治療意味著什么知之甚少。隨著單細(xì)胞和空間技術(shù)的出現(xiàn),科學(xué)家們正在彌合這一知識鴻溝。在這里,我們精選了四篇文章,研究人員在單細(xì)胞水平上定義和表征乳腺癌方面取得了重大進(jìn)展。通過這些研究能夠讓我們更多地了解不同類型乳腺癌的發(fā)展和轉(zhuǎn)移背后的機(jī)制,同時也將轉(zhuǎn)化研究和臨床試驗推向個性化治療,為乳腺癌的治療帶來希望。
01
創(chuàng)建圖譜:以單細(xì)胞、空間分辨率繪制人類乳腺癌
在第一項研究“人類乳腺癌的單細(xì)胞和空間解析圖譜”中[2],由加文醫(yī)學(xué)研究所的Sunny Wu博士帶領(lǐng)的研究人員使用Chromium Single Cell Gene Expression以及Visium Spatial Gene Expression來創(chuàng)建具有空間分辨率的乳腺癌單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜。對26個原發(fā)腫瘤進(jìn)行單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq),鑒定了所有腫瘤和亞型的所有主要細(xì)胞類型。將他們開發(fā)的用于內(nèi)在分子亞型分型的scRNA-seq兼容方法與從scRNA-seq數(shù)據(jù)中識別的基因特征相結(jié)合,從而能夠?qū)δ[瘤進(jìn)行分類并顯示重復(fù)基因模塊(GM)或?qū)е履[瘤內(nèi)常見的細(xì)胞異質(zhì)性的同期表達(dá)基因組。
在六個樣本上使用Visium空間基因表達(dá),發(fā)現(xiàn)TNBC樣本中GM3(EMT、IFN、MHC)和GM4(增殖標(biāo)志物)富集,而GM1和GM5(ER,管腔)富集了雌激素受體陽性(ER+)案例。有趣的是,研究發(fā)現(xiàn)GM3和GM4表型僅出現(xiàn)在其他表型不出現(xiàn)的乳腺癌區(qū)域。通過在單細(xì)胞和空間水平上進(jìn)一步描述乳腺腫瘤,它們的圖譜可用于改進(jìn)乳腺癌的分類。
02
通過跟蹤克隆擴(kuò)增來表征乳腺癌轉(zhuǎn)移
在第二項研究“乳腺癌轉(zhuǎn)移的部位決定了它們的克隆組成和可逆轉(zhuǎn)錄組學(xué)特征”中[3],由Olivia Newton-John癌癥研究所的Jean Berthelet博士帶領(lǐng)的科學(xué)家們采用了光學(xué)條形碼技術(shù)以及單細(xì)胞基因表達(dá)譜來研究TNBC轉(zhuǎn)移過程中克隆細(xì)胞的相互作用網(wǎng)絡(luò),與其他乳腺癌亞型相比,TNBC與更差的預(yù)后和更高的復(fù)發(fā)風(fēng)險相關(guān)。
對TNBC乳腺癌細(xì)胞系和兩個轉(zhuǎn)移部位(肺和肝)的條形碼亞克隆進(jìn)行scRNA-seq,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)移在肺中是高度多克隆的,但在肝中沒有。此外,亞克隆轉(zhuǎn)錄組變異性表明,在原發(fā)性腫瘤中占主導(dǎo)地位的亞克隆在發(fā)生轉(zhuǎn)移的組織中仍然占主導(dǎo)地位。比較不同條形碼亞克隆的基因表達(dá)譜,研究確定了1,366個差異表達(dá)基因的轉(zhuǎn)移位點驅(qū)動特征;其中,與肝轉(zhuǎn)移相比,腫瘤壞死因子-α通路在肺中強(qiáng)烈上調(diào)。這些結(jié)果表明TME驅(qū)動了轉(zhuǎn)移灶中的異質(zhì)性。
03
預(yù)測T細(xì)胞生物標(biāo)志物以進(jìn)行有效的免疫檢查點阻斷免疫療法
在第三項研究“乳腺癌患者抗PD1治療期間腫瘤內(nèi)變化的單細(xì)胞圖譜”中[4],VIB-KULeuven中心的博士生Ayse Bassez帶領(lǐng)科學(xué)家使用轉(zhuǎn)錄組和免疫分析構(gòu)建了腫瘤內(nèi)變化的單細(xì)胞圖譜。免疫檢查點阻斷(ICB)加化療可改善治療反應(yīng)[5],但并非所有患者都對新輔助ICB有反應(yīng)。為了探究原因,他們在化療前用抗PD1(一種常見的ICB抗體療法)治療了40名患者,并跟蹤了腫瘤內(nèi)的變化。
在兩個隊列中(一個接受抗PD1,一個接受化療,然后接受抗PD1)使用單細(xì)胞免疫分析對匹配的治療前和治療后活檢進(jìn)行scRNA-seq和T細(xì)胞受體作圖。9名患者在治療后進(jìn)行了T細(xì)胞克隆型擴(kuò)增。在選擇T細(xì)胞擴(kuò)增和治療階段時使用scRNA-seq數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)在抗PD1治療后表達(dá)PD1的T細(xì)胞增加。在處理前擴(kuò)增的T細(xì)胞與未擴(kuò)增的T細(xì)胞之間鑒定出差異表達(dá)的基因,發(fā)現(xiàn)T細(xì)胞中的表達(dá)特征可用于預(yù)測T細(xì)胞的擴(kuò)增。繪制的與抗PD1治療后T細(xì)胞擴(kuò)增相關(guān)的治療前免疫TME圖可以提供對臨床生物標(biāo)志物的深入了解。
04
解決原位管癌(乳腺癌的早期階段)的異質(zhì)性
在第四項研究“基因組分析揭示了乳腺原位導(dǎo)管癌的異質(zhì)性群體”中[6],東京大學(xué)的Satoi Nagasawa醫(yī)學(xué)博士帶領(lǐng)的一組科學(xué)家使用Visium空間基因表達(dá)來揭示乳腺癌腫瘤內(nèi)的細(xì)胞多樣性。導(dǎo)管原位癌(DCIS)是乳腺癌的早期階段,可能發(fā)展為浸潤性導(dǎo)管癌。然而,很難確定誰是高危需要手術(shù)的人,因此確定危險因素對評估和治療至關(guān)重要。
在這項研究中,研究人員首先使用傳統(tǒng)方法選擇并驗證了DCIS的基因組風(fēng)險因素—GATA3和PIK3CA突變。通過使用三個特定案例對DCIS進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組分析,結(jié)果表明具有GATA3突變的DCIS細(xì)胞有時會發(fā)展為浸潤性癌癥。然而,具有PIK3CA突變的DCIS細(xì)胞不會導(dǎo)致癌癥。總之,使用新標(biāo)記對DCIS進(jìn)行更準(zhǔn)確的分類對于決定正確的治療至關(guān)重要。
05
朝著更好的診斷和治療邁進(jìn)
很明顯,單細(xì)胞和空間技術(shù)正在推進(jìn)我們對乳腺癌發(fā)展、進(jìn)展和治療的理解,超出了使用傳統(tǒng)方法的想象。無論是使用新創(chuàng)建的空間轉(zhuǎn)錄組圖譜,還是使用基因表達(dá)和免疫分析來更好地描述疾病狀態(tài),臨床研究人員越來越多地掌握了更好地診斷、分層和提供針對乳腺癌的個性化治療的方法。
參考文獻(xiàn)
?https://www.breastcancer.org/symptoms/types/molecular-subtypes
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Berthelet J, et al. The site of breast cancer metastases dictates their clonal composition and reversible transcriptomic profile. Sci Adv 7: eabf4408 (2021). doi: 10.1126/sciadv.abf4408
Bassez A, et al. A single-cell map of intratumoral changes during anti-PD1 treatment of patients with breast cancer. Nat Med 27: 820–832 (2021). doi: 10.1038/s41591-021-01323-8
Schmid P, et al. Atezolizumab plus nab-paclitaxel as first-line treatment for unresectable, locally advanced or metastatic triple-negative breast cancer (IMpassion130): updated efficacy results from a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 3 trial. Lancet Oncol 21: 44–59 (2020). doi: 10.1016/S1470-2045(19)30689-8
Nagasawa S, et al. Genomic profiling reveals heterogeneous populations of ductal carcinoma in situ of the breast. Commun Biol 4: 438 (2021). doi: 10.1038/s42003-021-01959-9
基因檢測 ,是近幾年在癌癥治療領(lǐng)域比較火熱的關(guān)鍵詞;
乳腺癌 ,則是這些年始終霸占女性腫瘤發(fā)病率首位的噩夢。
鑒于乳腺癌相關(guān)基因的研究相比其它癌癥更為豐富透徹,市場上涌現(xiàn)出越來越多的乳腺癌基因檢測產(chǎn)品,而這些產(chǎn)品的定位幾乎清一色都是 評估健康人群未來罹患乳腺癌的風(fēng)險有多高 。
不少對乳腺癌心懷擔(dān)憂的女性似乎看到了曙光,但隨即又陷入疑惑:這種風(fēng)險評估有什么價值什么用不?可以作為乳腺癌篩查或者診斷的依據(jù)么?
這也正是本文想要討論的: 對多數(shù)健康女性而言,乳腺癌基因檢測的意義到底有多大?
先來看些 保守 官方的數(shù)據(jù)(當(dāng)然你也可以不看,知道情況很嚴(yán)峻就行啦)。
我國腫瘤登記年報顯示:2010年,在中國女性人群中,乳腺癌發(fā)病率位居首位,每年新發(fā)病例約21萬;死亡率位居第四,每年死亡人數(shù)約5萬。這么 籠統(tǒng) 巨大的數(shù)肯定沒啥實在感受,我大概除了下,換算成每天的話: 平均每天約有600名女性被確診為乳腺癌,150名女性死于乳腺癌 。
而在年齡因素上,中國女性診斷為乳腺癌的平均年齡為 45-55 歲(比西方女性更年輕?。?。來自上海和北京的數(shù)據(jù)顯示 乳腺癌有兩個發(fā)病高峰 :第一個出現(xiàn)在45-55 歲 ,另一個出現(xiàn)在70-74歲,并且診斷為乳腺癌的中位年齡有逐漸增大的趨勢(就是經(jīng)常聽到的“ 疾病年輕化 ”的意思)。
以上提到的這些數(shù)據(jù)確實足夠令人擔(dān)心了,然而和大多數(shù)疾病一樣,乳腺癌的確切病因至今尚無定論。其發(fā)病涉及到多種可能而復(fù)雜的因素, 遺傳因素 正是其中之一,這也就是基因檢測產(chǎn)品的立足點所在。
說到遺傳因素,相信很多小伙伴的理解就是“哎呀,這個我知道,我媽是雙眼皮,我也是!”,廣義來說是沒有錯的:父母各自將一半的DNA傳給子女,子女得到DNA以及這些DNA表達(dá)后帶來的各種……情況。嗯,請允許我使用這個通俗的詞語。而疾病,自然也屬于這些情況之一。
但是,父母將不正常的DNA傳遞至子女,也并不完全意味著疾病的直接傳遞,因為DNA與疾病之間還有十分復(fù)雜的對應(yīng)關(guān)系。大致來說,分為以下三種情況:
(1) 確定無疑型 :只要get了這個不正常的DNA,一定得病,而且50%的可能會將這個不正常的DNA繼續(xù)傳給下一代(因為只傳給下一代一半的染色體呀);
(2) 舉棋不定型 :get了這個不正常的DNA,雖然不一定得病,但得病概率比平常人高出很多,而且還是會以50%的可能將這個不正常的DNA繼續(xù)傳給下一代(原因同情況1);
(3) 不明所以型 :get的DNA是正常的,但后來因為自己瞎作等等莫名其妙的原因,把這個DNA搞得突變不正常了,此時大部分情況是回到情況2:雖然這個DNA不正常了,但不一定得病,只是得病概率比平常人高。但與情況2不同的是:這種情況下得病概率升高的程度相對小一些,而且一般不會遺傳給后代。
具體原因就比較復(fù)雜了,解釋起來估計就要偏題了,您還是先記著結(jié)論,我做個標(biāo)記,之后有篇幅我再給說道說道。
乳腺癌相關(guān)基因呢,在遺傳層面 屬于“舉棋不定型”和“不明所以型” (此處應(yīng)慶幸還好不是“確定無疑型”,不然更恐怖?。?,這兩種遺傳方式的官方學(xué)名叫做“ 多基因腫瘤遺傳易感 ”和“ 局部腫瘤細(xì)胞基因改變(后天獲得性 )”,也正是這兩種遺傳方式,將乳腺癌劃分為了傳說中傻傻分不清楚的“ 遺傳性乳腺癌 ”和“ 散發(fā)性乳腺癌 ”。
遺傳性乳腺癌 ,是指 明確知曉非正?;?的乳腺癌,其中最鼎鼎大名的就是 BRCA1和BRCA2基因 了(安吉麗娜·朱莉你肯定知道)。在普通人群中,女性一生中大約有 12% 的幾率會罹患乳腺癌,但如果攜帶BRCA1或BRCA2基因的有害突變,累計至80歲,患乳腺癌的風(fēng)險將上升至 40-60% !除了乳腺癌,BRCA1和BRCA2基因也與 卵巢癌 等多種癌癥息息相關(guān)。這個不是今天的主題,我們以后再說。
這里要解釋一個不少人都誤解或者是都不解的事情:
就拿乳腺癌的BRCA1和BRCA2基因來說:
其一,是因為不知道BRCA1或BRCA2基因到底是怎么引起乳腺癌的,只是嚴(yán)謹(jǐn)?shù)目茖W(xué)研究發(fā)現(xiàn)遺傳性乳腺癌患者中多數(shù)都發(fā)生了這兩種基因的突變;
其二,則是乳腺癌的發(fā)生可能不止需要滿足BRCA1或BRCA2基因突變,還需要其它某一個或幾個重要基因也同時發(fā)生突變(只是目前可能還未發(fā)現(xiàn)),這是一個多基因的復(fù)雜過程。
總的來說, 癌癥和基因突變具有非常非常復(fù)雜的相關(guān)性 ,它們的關(guān)系沒有大家想的那么單純,多數(shù)情況下都不是一一對應(yīng)的(為什么總覺得這句話別有他意呢……)。
那 散發(fā)性乳腺癌 又是什么情況呢?這個我們下節(jié)課再說,好奇的同學(xué)可以提前預(yù)習(xí)下。
好,下課。
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