2016年08月19日訊 8月17日,Nature封面介紹了至今為止世上最大人類基因變異數(shù)據(jù)庫(kù)
據(jù)報(bào)道
,2年前由多達(dá)100人的研究團(tuán)隊(duì)建立了外顯子組(exome)超過(guò)1000萬(wàn)變異的數(shù)據(jù)庫(kù)。研究作者們編制的該數(shù)據(jù)庫(kù),利用來(lái)自20多個(gè)疾病研究的DNA數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。ExAC在2014年在網(wǎng)上公布,被查詢了超過(guò)500萬(wàn)次。外顯子組僅是人類基因組的一小部份,占DNA的不到2%
,但具關(guān)鍵重要性。每個(gè)人都有成千上萬(wàn)個(gè)變異
《自然》(Nature)期刊刊登的第一個(gè)分析這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的研究,證實(shí)有很大的潛力可精確標(biāo)出遺傳疾病成因
。研究作者麥克阿瑟(Daniel MacArthur)目前是美國(guó)麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)的布洛德研究所(Broad Institute)醫(yī)學(xué)和人口遺傳學(xué)共同負(fù)責(zé)人
,他說(shuō):“研究讓我們有能力發(fā)現(xiàn)罕見(jiàn)的變異,對(duì)窺探罕見(jiàn)遺傳疾病的根源,提供無(wú)可比擬窗口。”外顯子組整合聯(lián)合(Exome Aggregation Consortium
, ExAC)數(shù)據(jù)庫(kù)匯集數(shù)10個(gè)既有研究,試圖彌補(bǔ)不足。數(shù)據(jù)庫(kù)包含來(lái)自6萬(wàn)多人的蛋白質(zhì)編碼細(xì)部數(shù)據(jù)。在這篇Nature封面研究發(fā)表的同一天
,NEJM和Nature Genetics都各有一篇研究文章發(fā)表,都運(yùn)用這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)糾正了之前對(duì)DNA變異和疾病的觀點(diǎn)。NEJM:利用ExAC數(shù)據(jù)庫(kù)可避免遺傳性誤診
同一天發(fā)表在NEJM的一篇文章指出
,這種“遺傳性誤診”側(cè)重于一種遺傳性疾病稱為肥厚型心肌病。眾所周知,心臟肌肉變厚會(huì)影響泵血。在一個(gè)實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)了三年的記錄中
,發(fā)現(xiàn)有七名患者被告知他們攜帶了兩種與心臟病有聯(lián)系的DNA變異。兩變種后來(lái)被重新分類為良性。其中有5名是非洲裔,如果這些變種的原始研究已經(jīng)包含了足夠美國(guó)黑人的樣本,他們可能不會(huì)得出錯(cuò)誤的結(jié)論。科學(xué)家介紹新的數(shù)據(jù)庫(kù)ExAC
,可以避免這樣的錯(cuò)誤。它提供了一個(gè)比過(guò)去更全面的DNA變化的集合。來(lái)自歐洲,非洲,南亞,東亞和拉丁美洲血統(tǒng)的人大約1000萬(wàn)個(gè)微小的變化已被列出。Nature Genetics:利用ExAC數(shù)據(jù)庫(kù)可糾正拷貝數(shù)差異(CNV)
在同一天發(fā)布在Nature Genetics另一項(xiàng)研究中,在ExAC近6萬(wàn)人的外顯子數(shù)據(jù)中分析了罕見(jiàn)拷貝數(shù)差異(CNV)的比例和特性
對(duì)于每個(gè)基因
ExAC 的CNV數(shù)據(jù)在人類基因差異譜系中是一個(gè)重要的組成部分
Nature:利用ExAC數(shù)據(jù)庫(kù),醫(yī)學(xué)更接近真實(shí)
在Nature文章中的分析對(duì)于運(yùn)用ExAC如何指出過(guò)去的錯(cuò)誤提供了另一個(gè)例子
研究人員發(fā)現(xiàn)在新的標(biāo)準(zhǔn)下
,至少163例該被重新歸類為良性或者可能是良性。在去年11月,研究者報(bào)道了126種這樣的差異被重新分類。但是科學(xué)家們指出比ExAC更大的數(shù)據(jù)庫(kù)也需要精準(zhǔn)地將遺傳變異聯(lián)系到疾病或者排除,未來(lái)
,我們還有很長(zhǎng)的路要走。本文地址:http://www.mcys1996.com/jiankang/275994.html.
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