近日
2月10日
,位于倫敦的英國癌癥研究院宣布將會在未來5年投資2000萬英鎊資助Hannon的研究團(tuán)隊、天文學(xué)家以及游戲設(shè)計師,幫助其開發(fā)乳腺癌的交互式虛擬現(xiàn)實(shí)地圖,研究者表示,他們所飛躍的這種腫瘤僅僅是一種模型,而真正的模型應(yīng)該包括腫瘤中每一個細(xì)胞中成千上萬個基因以及多種蛋白的表達(dá)數(shù)據(jù),研究者希望這種空間和功能的細(xì)節(jié)能夠幫助其揭示影響腫瘤對療法產(chǎn)生反應(yīng)的多個因素。這項計劃僅僅是字符串中的一個字符而已,而研究人員的目的在于構(gòu)建出新型的細(xì)胞地圖集
,即對器官或腫瘤的繪圖能夠清楚描述出每個細(xì)胞的組成和位置的詳細(xì)細(xì)節(jié)信息;同時英國癌癥研究院還給另外一個團(tuán)隊獎勵了1600萬英鎊用來開發(fā)重點(diǎn)關(guān)注代謝產(chǎn)物及蛋白質(zhì)的類似腫瘤圖譜;去年美國國家精神衛(wèi)生研究所為細(xì)致地繪制出小鼠大腦圖譜的研究者進(jìn)行了頒獎,同時在2月23至24日,研究人員齊聚斯坦福大學(xué)關(guān)于如何繼續(xù)進(jìn)行人類細(xì)胞地圖集的計劃進(jìn)行了討論。細(xì)胞重疊
來自魏茨曼科學(xué)研究院從事免疫系統(tǒng)基因組學(xué)研究的科學(xué)家Ido Amit表示
,這是一個非常熱門的話題。在過去很多年里,研究者們聚集了很多技術(shù)來幫其對單個細(xì)胞中的滿額RNAs進(jìn)行測序,這些RNAs能夠反映基因的表達(dá)情況,同時也能夠為研究人員提供關(guān)于器官或腫瘤內(nèi)部細(xì)胞特殊功能的相關(guān)線索。但測序方法通常要求從組織中首先分離出活著的細(xì)胞
,但這就會破壞關(guān)于細(xì)胞所處位置以及和其發(fā)生相互作用的“鄰居”細(xì)胞的關(guān)鍵信息,這些信息也能夠為科學(xué)家們理解細(xì)胞功能以及其在疾病組織中所扮演的角色提供相關(guān)研究線索。來自瑞典卡羅琳學(xué)院的分子生物學(xué)家Nicola Crosetto表示,目前單細(xì)胞測序技術(shù)為我們帶來了很大希望,但當(dāng)我們考慮到癌癥和一些復(fù)雜的生理學(xué)組織時,我們就需要將這些信息放到空間環(huán)境中進(jìn)行研究而這種技術(shù)如今正在開始出現(xiàn)
,2月6日,研究者Amit和Shalev Itzkovitz就報告,他們利用RNA測序技術(shù)對每一個細(xì)胞進(jìn)行測序,最后開發(fā)出了一種小鼠肝臟小葉的細(xì)胞層疊圖譜(a cell-by-cell map),肝臟小葉組織能夠被分為同心層,而且研究者發(fā)現(xiàn),在位于兩層界面中的細(xì)胞中會出現(xiàn)特殊的基因表達(dá)模式,該組織的這塊區(qū)域并不只是一個過渡區(qū),而是一種具有特殊功能的新區(qū)域。緊盯著蛋白質(zhì)
與此同時
,研究者Greg Hannon和哈佛大學(xué)的生物物理學(xué)家莊小威團(tuán)隊開始開展合作,此前莊小威團(tuán)隊開發(fā)出了一種能夠利用二進(jìn)制條碼編碼RNAs的新方法,同時這種新方法還可以利用成像技術(shù)對細(xì)胞單元格進(jìn)行讀取,這種新技術(shù)能夠同時對單個細(xì)胞中數(shù)千個RNAs進(jìn)行檢測,同時還不會使得這些細(xì)胞游離出自己的“鄰居”細(xì)胞;研究者莊小威表示,每次當(dāng)我利用突出的條形碼來觀察細(xì)胞的時候,都會讓我想起電影《黑客帝國》。相比研究蛋白質(zhì)和其它分子的功能而言
,對RNA的分子繪圖看起來非常簡單,來自英國國家物理實(shí)驗室的科學(xué)家Josephine Bunch及其同事就開發(fā)出了一種特殊的腫瘤地圖集,該地圖集中包含了關(guān)于小型分子的詳細(xì)信息,比如脂質(zhì)、藥物以及代謝產(chǎn)物,同時還包括一些大分子,比如蛋白質(zhì),這種方法就能夠幫助研究人員對每一份樣品中大約50種蛋白質(zhì)進(jìn)行評估。相比利用其它技術(shù)對數(shù)千個RNAs進(jìn)行測定而言,當(dāng)然這聽起來或許并不是那么讓人印象深刻
,但對來自特殊組織中的50種不同組合的蛋白質(zhì)進(jìn)行解析就足以幫助研究人員鑒別主要的細(xì)胞類型以及關(guān)鍵的分子途經(jīng)。來自斯坦福大學(xué)的研究者Garry Nolan表示,相比RNA而言,蛋白質(zhì)能夠更加直接地為我們提供研究細(xì)胞功能的視角以及關(guān)鍵信息,同時也能夠更好地幫助研究人員將當(dāng)前的研究數(shù)據(jù)同幾十年前的細(xì)胞地圖集聯(lián)系起來。不管這種方法是否足夠卓越
本文地址:http://www.mcys1996.com/jiankang/278149.html.
聲明: 我們致力于保護(hù)作者版權(quán),注重分享
上一篇:
?" rel="prev">
對甜食上癮
下一篇:
白帶呈水狀且干后偏黃綠色