迄今為止最全面的人類蛋白質(zhì)編碼區(qū)遺傳變異記錄

2016年08月19日訊 一項關于人類基因組外顯子組（蛋白質(zhì)編碼區(qū)）的深度分析提供了迄今為止有關該區(qū)域最全面的遺傳變異記錄。登上本周《自然》雜志封面的研究 Analysis of protein-coding genetic variation in 60，706 humans 被認為有助于從臨床發(fā)現(xiàn)與人類疾病相關的遺傳變異。

來自哈佛-麻省理工博德研究所，參與人類外顯子組整合數(shù)據(jù)庫（ExAC）項目的 Daniel MacArthur 及同事分析了來自60，706位被試者的外顯子組測序數(shù)據(jù)，這些被試者來自于不同的地理人口系譜，包括歐洲、非洲、南亞、東亞和拉美人口。他們發(fā)現(xiàn)了約740萬個遺傳子多態(tài)（genetic variants），對于人類低頻蛋白質(zhì)編碼多態(tài)的分析，其分辨率達到前所未有的程度。

作者通過分析該數(shù)據(jù)集來表征全球遺傳變異的模式，在較小的遺傳變異數(shù)據(jù)集上達到了此前無法實現(xiàn)的分辨率。遺傳變異密度令研究人員得以在同一位點分辨多重序列多態(tài)（多等位基因多態(tài)），而數(shù)據(jù)集的規(guī)模則令研究人員得以首次獲得一些有關復發(fā)突變的發(fā)現(xiàn)，復發(fā)突變指的是罕見突變在各人口歷史中獨立發(fā)生。

ExAC提供了一個可公開獲取的參照數(shù)據(jù)庫，事實已經(jīng)證明這是一個有用的臨床工具，可用于評估潛在的孟德爾遺傳?。▎位虿。┑闹虏』蚨鄳B(tài)，其中一些多態(tài)在人口中的普遍程度令人難以置信。作者分析了過往研究所報告的192個此類多態(tài)，結(jié)果發(fā)現(xiàn)僅9個有充足的數(shù)據(jù)表明其與疾病相關。

在另外一篇發(fā)表在Genetics in Medicine的論文 Reassessment of Mendelian gene pathogenicity using 7，855 cardiomyopathy cases and 60，706 reference samples 中，倫敦帝國理工學院的Roddy Walsh 及同事評估了最常見的嚴重的孟德爾病之一 - 心肌癥（心肌疾?。┑倪z傳變異情況。他們的發(fā)現(xiàn)表明，此前認為與特定心肌癥相關的許多基因和基因多態(tài)可能并沒有真的關系，不過現(xiàn)在利用ExAC可以顯著改進對基因變體的解讀。

在發(fā)表在Nature Genetics上的另外一篇論文 Patterns of genic intolerance of rare copy number variation in 59，898 human exomes中，西奈山伊坎醫(yī)學院的 Douglas Ruderfer 及同事分析了ExAC數(shù)據(jù)集內(nèi)罕見的拷貝數(shù)變異（一種基因組結(jié)構(gòu)變異）。

一直有研究設法記錄外顯子組內(nèi)的遺傳變異，而ExAC是其中規(guī)模最大最全面的一個項目。在伴隨的新聞與觀點版塊中，西雅圖華盛頓大學的 Jay Shendure 總結(jié)說：“ExAC既是一項技術成就，也是一項政治成就，不僅有數(shù)據(jù)爭議，也有研究者、審批許可和14余項研究的角力 - 主要針對的是各種常見疾病的遺傳問題?！?/p>

本文地址:http://www.mcys1996.com/jiankang/303817.html.

聲明： 我們致力于保護作者版權，注重分享，被刊用文章因無法核實真實出處，未能及時與作者取得聯(lián)系，或有版權異議的，請聯(lián)系管理員，我們會立即處理，本站部分文字與圖片資源來自于網(wǎng)絡，轉(zhuǎn)載是出于傳遞更多信息之目的,若有來源標注錯誤或侵犯了您的合法權益，請立即通知我們(管理員郵箱：douchuanxin@foxmail.com)，情況屬實，我們會第一時間予以刪除，并同時向您表示歉意,謝謝!

上一篇: 輸入年輕血液，真的能“返老還童”？(···

下一篇: 神經(jīng)性疼痛：分型論治效果好