2016年09月05日訊 最近,來自巴塞爾大學(xué)、蘇黎世聯(lián)邦理工大學(xué)和NCCR分子系統(tǒng)工程的科學(xué)家,開發(fā)了一種人工金屬酶,可催化細(xì)胞內(nèi)的反應(yīng),在大自然中沒有等價(jià)物。這可能是“在活細(xì)胞內(nèi)創(chuàng)建新的非自然代謝途徑”的最好例子。
這種人工金屬酶,稱為biot-Ru-SAV,是采用生物素-鏈親和素技術(shù)制備而成的。這種方法依賴于蛋白質(zhì)鏈霉親和素對(duì)維生素生物素的高親和力,其中結(jié)合生物素的化合物可以被引入到蛋白質(zhì),以產(chǎn)生人工酶。在這項(xiàng)研究中,作者介紹了一種金屬有機(jī)化合物,它的底部有金屬釕。有機(jī)金屬化合物在一個(gè)金屬原子和一個(gè)碳原子之間至少有一個(gè)鍵,通常用于工業(yè)化學(xué)反應(yīng)的催化劑。然而,如果真起作用的話,有機(jī)金屬催化劑在水溶液中或細(xì)胞環(huán)境中的表現(xiàn)并不佳,需要被合并到像鏈霉親和素這樣的蛋白支架,來克服這些局限。
該研究的資深作者、巴塞爾大學(xué)化學(xué)系教授Thomas R Ward說:“我們的目標(biāo)是制備一種人工金屬酶,可以催化烯烴復(fù)分解反應(yīng),這是不存在于天然酶當(dāng)中的一種反應(yīng)機(jī)制?!毕N復(fù)分解反應(yīng)是一種方法,用于碳碳雙鍵的形成和再分配,碳碳雙鍵被廣泛用于各種化學(xué)產(chǎn)品的實(shí)驗(yàn)室研究和大規(guī)模工業(yè)生產(chǎn)。Biot-Ru-SAV可催化一種關(guān)環(huán)復(fù)分解反應(yīng),以生產(chǎn)一種易于檢測(cè)和定量熒光分子。
然而,活細(xì)胞內(nèi)的環(huán)境難以實(shí)現(xiàn)有機(jī)金屬酶的正常運(yùn)作。蘇黎世聯(lián)邦理工大學(xué)生物系統(tǒng)科學(xué)與工程系的Markus Jeschek說:“主要的突破是,‘使用大腸桿菌的周質(zhì)作為反應(yīng)室’的這個(gè)想法,其環(huán)境更適合于烯烴復(fù)分解催化劑?!敝苜|(zhì)--革蘭氏陰性菌的內(nèi)細(xì)胞膜和細(xì)菌外膜之間的間隙,含有低濃度的金屬酶抑制劑,如谷胱甘肽。
作者發(fā)現(xiàn)在體內(nèi)條件下是理想的,之后又進(jìn)了一步,決定通過采用定向進(jìn)化原則--這種方法模擬自然選擇的過程來進(jìn)化出性能或活性增強(qiáng)的蛋白質(zhì),來優(yōu)化biot-Ru-SAV。Ward解釋說:“然后,我們可以開發(fā)一種簡(jiǎn)單和可靠的篩選方法,可讓我們測(cè)試幾千個(gè)biot-Ru-SAV突變體,并識(shí)別最活躍的變種?!?/p>
作者不僅能顯著改善biot-Ru-SAV的催化特性,而且也表明,這種有機(jī)金屬基酶可以被設(shè)計(jì)和優(yōu)化成不同的底物,從而產(chǎn)生各種不同的化學(xué)產(chǎn)品。Ward說:“這一結(jié)果令人興奮的地方在于,像biot-Ru-SAV這樣的人工金屬酶,可用于生產(chǎn)新的高附加值化學(xué)品。它有很多的潛力,可結(jié)合化學(xué)和生物學(xué)工具,最終利用細(xì)胞作為分子工廠?!?/p>
2014年12月,英國醫(yī)學(xué)研究委員會(huì)(Medical Research Council,MRC)的科學(xué)家們生成了世界上第一個(gè)由人工遺傳物質(zhì)制成的酶。他們的合成酶,是由自然界中不會(huì)產(chǎn)生的分子制成,能夠在實(shí)驗(yàn)室引發(fā)化學(xué)反應(yīng)。
1.1用基因槍法獲得的轉(zhuǎn)基因小麥 1992年對(duì)利用現(xiàn)代生物技術(shù)改良小麥而言是具有歷史意義的一年。Vasil等以長期培養(yǎng)的胚性愈傷組織為外植體,通過基因槍將GUS/Bar基因?qū)胄←溒贩N“Pavon”,獲得對(duì)除草劑Basta具有抗性再生植株(T0)及其后一下(T1),從而宣告世界上第一株轉(zhuǎn)基因小麥問世。一年后,同一研究組又對(duì)基因方法進(jìn)行了優(yōu)化,以未成熟胚及其愈傷組織為外植體,在3個(gè)小麥基因型(Pavon、Bobwhite和RH770019)上獲得成功,并且將獲得轉(zhuǎn)基因小麥植株的時(shí)間由15個(gè)月縮短至7-9個(gè)月。在這一年,Weeks等也報(bào)道以品種“Bobwhite”的未成熟胚為外植體通過基因槍法獲得轉(zhuǎn)基因小麥植株。兩個(gè)獨(dú)立的實(shí)驗(yàn)室用同一品種(Bobwhite)的相同組織(未成熟胚)和相同的方法(基因槍法)都得到相同或相似的結(jié)果(獲得轉(zhuǎn)基因植株),表明所用的轉(zhuǎn)基因方法是可靠的。此后,以未成熟胚(或稱為“幼胚”)及其衍生物為外植體,通過基因槍法獲得轉(zhuǎn)基因小麥的報(bào)道與日俱增,已經(jīng)成為迄今為止小麥基因轉(zhuǎn)導(dǎo)的主要方法。值得一提的是,以小麥胚頂端分生組織、營養(yǎng)體頂端分生組織和花序分生組織為目標(biāo),用“手持式”基因槍射擊也獲得外源基因的瞬時(shí)表達(dá)和轉(zhuǎn)基因植株。這一方法能繞過全能性細(xì)胞數(shù)量的問題,在小麥基因轉(zhuǎn)導(dǎo)上具有一定的潛力。
1.2用花粉管通道法獲得的轉(zhuǎn)基因小麥 利用花粉管通道法轉(zhuǎn)導(dǎo)小麥的工作主要集中在前5年(1990-1995),而且主要集中在我國。周文麟等報(bào)道,將C4作物的DNA通過花粉管導(dǎo)入春小麥,獲得具有C4若干性狀的轉(zhuǎn)“基因”小麥及其后代。成卓敏等稱獲得轉(zhuǎn)小麥黃矮病毒CP基因的小麥,曾君祉等劉根齊等也報(bào)道了花粉管通道法轉(zhuǎn)基因小麥的獲得。遺憾的是,當(dāng)時(shí)這些報(bào)道都缺乏外源基因(或DNA)在轉(zhuǎn)基因小麥植株及其后代中整全和表達(dá)的分子生物學(xué)證據(jù)。最近,Zeng(曾君祉)和Wu等對(duì)1990-1994期間通過花粉管通道法獲得的轉(zhuǎn)基因小麥的后代進(jìn)行了外源“基因”表達(dá)的分析,包括分子生物學(xué)方法的分析,證明了外源基因的整合和表達(dá),從而證明通過花粉管通道法可以獲得轉(zhuǎn)基因小麥。周文麟、倪建福等(個(gè)人通信)用我們構(gòu)建的eMS/Bar嵌合基因轉(zhuǎn)導(dǎo)小麥,獲得具有除草劑抗性和雄性不育性狀的植株,其后代仍然表現(xiàn)出對(duì)除草劑的抗性。花粉管通道法避免了復(fù)雜的組織培養(yǎng)、植株再生過程,在小麥上是很有潛力的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)方法。
1.3其它直接法獲得的轉(zhuǎn)基因小麥 其它直接法,如顯微注射、激光微束穿刺、PEG介導(dǎo)和電激等對(duì)小麥的轉(zhuǎn)化近乎無效。盡管已經(jīng)有眾多的研究證明外源基因在用這些直接法處理后的原生質(zhì)體和細(xì)胞中能瞬時(shí)表達(dá)乃至能在產(chǎn)生的愈傷組織中的穩(wěn)定表達(dá),但獲得轉(zhuǎn)基因小麥植株的報(bào)道僅有一例。He等以品種“Hartog”的原生質(zhì)體為受體,通過電激法獲得具有除草劑(PPT)抗性的綠色轉(zhuǎn)基因植株,但這些植株未能結(jié)籽。小麥原生質(zhì)體或單細(xì)胞植株再生的困難可能是電激法、PEG法和顯微注射法等直接法在小麥轉(zhuǎn)基因上失敗的主要原因。正是由于這些困難,使以原生質(zhì)體或單細(xì)胞為受體的直接法在小麥基因轉(zhuǎn)導(dǎo)上的前景變得十分黯淡。
1.4農(nóng)桿菌介導(dǎo)法獲得的轉(zhuǎn)基因小麥 自1983年第一株農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因植株問世一來,農(nóng)桿菌介導(dǎo)法很快就成為雙子葉植物基因轉(zhuǎn)導(dǎo)的主導(dǎo)方法。這一方法操作容易、成本低、轉(zhuǎn)化效率高、單拷貝基因整合率高而且外源基因在轉(zhuǎn)基因植株后代中比較穩(wěn)定。能否將這一方法引入包括小麥在內(nèi)的單子葉植物的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)成為90年代前后討論與研究的熱點(diǎn)。當(dāng)時(shí),一種傾向性的觀點(diǎn)是認(rèn)為單子葉植物不是農(nóng)桿菌的天然寄主,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化單子葉植物幾乎不可能或沒有可能性。這種觀點(diǎn)的代表人物是曾在小麥等禾谷類作物組織培養(yǎng)與基因槍轉(zhuǎn)導(dǎo)方面卓有建樹的瑞士科學(xué)家Potrykus,他在國際權(quán)威雜志“Bio/Technology”和“Nature”都發(fā)表了他的悲觀論點(diǎn)。農(nóng)桿菌介導(dǎo)的石刁柏轉(zhuǎn)基因植株的獲得,特別是農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因水稻和轉(zhuǎn)基因玉米的獲得,不僅改變了單子葉植物不是農(nóng)桿菌的天然寄主的看法,而且證明農(nóng)桿菌介導(dǎo)法完全可以用于禾谷類作物的遺傳轉(zhuǎn)化。
在小麥上,雖然有人早在1988年就證明農(nóng)桿菌能侵染并進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化,隨后又有人證明農(nóng)桿菌能附著到經(jīng)部分酶解和未酶解的小麥幼胚細(xì)胞,但多年來一直沒有得到轉(zhuǎn)基因植株。Hess等報(bào)道,直接將農(nóng)桿菌接種到小穗獲得具有抗生素性和經(jīng)Southern Blot雜交證明的轉(zhuǎn)基因當(dāng)代植株,外源基因部分在F1和F2中卻未能檢測(cè)到外源基因的存在。在人工授粉后再用攜帶有共合載體(pCV2260和pSIR42)的農(nóng)桿菌(株系C158)處理雌蕊,Pukhal’skii獲得經(jīng)過PCR和Southern Blot雜交證明的F1植株,并由此獲得具有外源基因的F2植株。這種簡(jiǎn)單的基因轉(zhuǎn)化方法,結(jié)合了花粉通道與農(nóng)桿菌侵染的優(yōu)勢(shì),如果能夠被其它實(shí)驗(yàn)室所證實(shí),將在小麥等的基因轉(zhuǎn)化上發(fā)揮主導(dǎo)作用。
在農(nóng)桿菌介導(dǎo)小麥基因轉(zhuǎn)導(dǎo)方面,Cheng等于1997打破了十幾年的沉默,首次獲得的正常的轉(zhuǎn)基因小麥植株。2年后,我國科學(xué)工作者夏光敏等報(bào)道獲得農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因小麥植株,筆者的研究組也同樣成功地獲得農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因小麥植株(待發(fā)表)。這種成功意味著,小麥也能象雙子葉植物一樣享受農(nóng)桿菌介導(dǎo)基因轉(zhuǎn)化的所有優(yōu)點(diǎn)。
結(jié)合農(nóng)桿菌介導(dǎo)與基因槍法的“Agrolistic”法,或通過微彈造成的微孔來幫助農(nóng)桿菌附著及其所含質(zhì)粒向受體細(xì)胞的轉(zhuǎn)移,或把分別攜帶有 VirDl、VirD2和T-DNA的邊界序列加外源片段的三個(gè)質(zhì)粒導(dǎo)入受體,通過VirDl和VirD2在受體中的正常表達(dá)促使外源目標(biāo)片段采用T-DNA邊界序列以較低的拷貝數(shù)插入受體的基因組中,已經(jīng)在小麥的基因轉(zhuǎn)化上嶄露頭角。超聲波輔助的農(nóng)桿菌介導(dǎo)法(Sonication-assisted Agrobacterium-mediated transformation ,SAAT)通過超聲波在受體細(xì)胞上產(chǎn)生的微孔來幫助農(nóng)桿菌附著及其所含質(zhì)粒向受體細(xì)胞的轉(zhuǎn)移,使外源基因在小麥?zhǔn)荏w細(xì)胞的瞬時(shí)表達(dá)強(qiáng)度相對(duì)純農(nóng)桿菌法增加至少100倍。Singh和Chawla和Serik等還利用碳化硅纖維(silicon carbide fibeers)來輔助農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)基因。此外,還有結(jié)合農(nóng)桿菌與病毒的“Agroinfection ”法等。這些方法目前雖然還不成熟,但在小麥基因轉(zhuǎn)導(dǎo)方面具有很大的潛力。
2、小麥基因轉(zhuǎn)化的受體
作為基因轉(zhuǎn)化的受體取決于所用的轉(zhuǎn)基因方法,而受體操作的難易程度又決定了轉(zhuǎn)基因方法的成敗。
小麥胚性懸浮細(xì)胞及其分離出的原生質(zhì)體多用作電激法、PEG法和顯微注射法等直接轉(zhuǎn)基因法的受體。正是由于原生質(zhì)體和懸浮細(xì)胞再生植株的困難,使電激法等直接法在小麥的基因轉(zhuǎn)化方面沒有多少“用武之地”。小麥的胚性愈傷組織,特別是幼胚及其愈傷組織和幼胚盾片及其愈傷組織具有較強(qiáng)的植株再生能力 (有人認(rèn)為它們具有較大比例的全能性細(xì)胞),無論作為基因槍法的受體還是作為農(nóng)桿菌介導(dǎo)法的受體都能再生出轉(zhuǎn)基因植株,從而成為迄今為止小麥基因轉(zhuǎn)化的主要受體,同時(shí)也使基因槍法成為目前小麥的主要轉(zhuǎn)基因方法,也有可能使農(nóng)桿菌介導(dǎo)法成為今后小麥基因轉(zhuǎn)化的主要方法。筆者研究組近年的實(shí)驗(yàn)結(jié)果 (待發(fā)表)表明,小麥花藥愈傷組織的再生能力很強(qiáng),經(jīng)基因槍轟擊后比較容易獲得轉(zhuǎn)基因植株,因而也是小麥轉(zhuǎn)基因的良好受體。小麥的各種分生組織作為“手持式”基因槍的受體具有較大的利用潛力,但這一潛力的發(fā)揮還有待這種基因槍本身的完善和經(jīng)濟(jì)可利用性。雌蕊,作為花粉管通道法及農(nóng)桿菌一花粉通道法的唯一受體,隨著這些轉(zhuǎn)基因方法的完善將在小麥轉(zhuǎn)基因方面發(fā)揮越來越重要的作用,有可能發(fā)揮主導(dǎo)作用。小孢子、花粉、大孢子和葉基作為小麥轉(zhuǎn)基因的受體可能得到進(jìn)一步的開發(fā),但在不久的將來,不可能成為主要受體。幼穗可能是進(jìn)行小麥基因轉(zhuǎn)化一個(gè)很好的受體。陳梁鴻在比較幼穗和幼胚為受體的轉(zhuǎn)化試驗(yàn)中觀察到,幼穗的轉(zhuǎn)化效果優(yōu)于幼胚。
3、小麥基因轉(zhuǎn)化的目標(biāo)基因和選擇
標(biāo)志基因到目前為止,在雙子葉植物基因轉(zhuǎn)化中常用的選擇基因和報(bào)告基因仍然多作為小麥遺傳轉(zhuǎn)化的目標(biāo)基因兼選擇基因,這些基因主要有報(bào)告基因類的GUS、CAT和LUC;抗抗生素類的NptII、Hpt和抗除草劑類的Bar、EPSPs、Bxn、CP4和GOX。這些基因在小麥上利用主要是為了建立有效的遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng)。隨著小麥遺傳轉(zhuǎn)化體系的建立和完善,旨在改良小麥性狀的真正的目標(biāo)基因的利用不斷增多。迄今為止,已經(jīng)導(dǎo)入小麥并在轉(zhuǎn)基因植株中得到表達(dá)的目標(biāo)基因主要有:①改良小麥加工品質(zhì)方面的基因:高分子量谷蛋白亞基(HMW Glutenin subunit)基因lAxl、lDx5和lDxl0和重組高分子量谷蛋白亞基基因。②抗病基因:病毒外殼蛋白基因(Coat protein genes,CP)、類萌芽素蛋白(germin-like proteins,GLPs)基因、水稻thaumatin-like 蛋白基因TLP、藜蘆醇合成酶(stilbene synthase )基因、大麥種子核糖滯活蛋白(ribosom-inactivating protein,RIP)基因和玉米Ds轉(zhuǎn)座子; ③嵌合雄性不育類基因:核糖核酸酶類基因Barnase、細(xì)胞骨架蛋白基因等;④抗除草劑類基因:Bar、EPSPs、Bxn、CP4和GOX。
在雙子葉植物上廣泛作為選擇基因的抗抗生素類基因,如NptII和Hpt等,在小麥轉(zhuǎn)基因上應(yīng)用較少。其主要原因有兩個(gè):第一是小麥對(duì)Kan具有較高的天然抗性,第二是,人們對(duì)小麥含抗生素基因的安全性的憂慮。到目前為止,在轉(zhuǎn)基因小麥中應(yīng)用得最多的選擇基因是抗除草劑基因Bar。
報(bào)告基因GUS、CAT和LUC曾為小麥基因轉(zhuǎn)化體系的建立作出重大貢獻(xiàn)。但在小麥轉(zhuǎn)基因體系基本成熟的今天,人們已經(jīng)開始尋求其它的基因以代替上述單純的報(bào)告基因或者根本不再利用報(bào)告基因。值得一提的是外觀可見報(bào)告基因(visual marker)。McCormac等和Mentewab等用花色素苷生物合成促進(jìn)基因(anthocyanin biosynthesis stimulatory genes),如Cl/Lc,作為報(bào)告基因,通過對(duì)轉(zhuǎn)化受體及其細(xì)胞的顏色來選擇轉(zhuǎn)化子。這是一種具有廣泛應(yīng)用價(jià)值的報(bào)告基因。另外,合成的綠色熒光蛋白基因(SGFP-S65T)也已用于報(bào)告小麥的基因轉(zhuǎn)化。
4、外源基因在轉(zhuǎn)基因小麥中的表達(dá)與表達(dá)分析
廣泛應(yīng)用于在轉(zhuǎn)基因植物中組成型表達(dá)外源基因的啟動(dòng)子CaMV 35s在谷物類中的作用較弱。為了增強(qiáng)外源基因在轉(zhuǎn)基因小麥中的表達(dá),人們或利用雙CaMV35s序列,或加入單子葉植物基因的插入子(如玉米Adhl基因的插入子),或轉(zhuǎn)而利用單子葉植物基因的啟動(dòng)子,如水稻的Actl基因的啟動(dòng)子和玉米Ubil基因的啟動(dòng)子。Actl和Ubil啟動(dòng)子是目前在小麥轉(zhuǎn)基因中應(yīng)用最普遍的組成型啟動(dòng)子。另外,人工重組的組成型啟動(dòng)子pEmuGN啟動(dòng)外源基因在轉(zhuǎn)基因小麥等的表達(dá)強(qiáng)度比CaMV35s高至少10倍。這類重組啟動(dòng)子在小麥遺傳轉(zhuǎn)化上將大有作為。
組織和/或器官特異性表達(dá)啟動(dòng)子的應(yīng)用在小麥轉(zhuǎn)基因上是一個(gè)巨大的進(jìn)步。特別值得一提的是花藥花粉特異性啟動(dòng)子的利用。De Block等以水稻花藥絨氈層特異性啟動(dòng)子ca驅(qū)動(dòng)核糖核酸酶基因Barnse在轉(zhuǎn)基因小麥中表達(dá),從而在世界上創(chuàng)造出第一株基因工程雄性不育小麥。筆者的研究組利用煙草花藥絨氈層特異性啟動(dòng)子TA29也創(chuàng)造出基因工程雄性不育小麥。基因工程雄性不育小麥的完善與配套,將徹底改變目前雜交小麥制種難的狀況。另外,化學(xué)誘導(dǎo)性啟動(dòng)子在轉(zhuǎn)基因小麥上也具有巨大的應(yīng)用潛力。
近年來,對(duì)外源基因在轉(zhuǎn)基因小麥上的整合、表達(dá)方式已經(jīng)有一定的研究,包括分子方面的研究。一般認(rèn)為,外源基因在轉(zhuǎn)基因小麥上的整合方式與所用的轉(zhuǎn)基因方法有關(guān),但無論是用基因槍還是農(nóng)桿菌介導(dǎo)法,低拷貝與簡(jiǎn)單的整合仍然是占優(yōu)勢(shì)的整合方式;導(dǎo)入基因的遺傳在大多數(shù)轉(zhuǎn)基因系法后代中呈孟德爾遺傳。Bieri等的實(shí)驗(yàn)證明,與MARs(matrix-associated regions)的目標(biāo)基因(RIP)在轉(zhuǎn)基因小麥的后4代仍然非常穩(wěn)定,但Alvarez等觀察到在T2代有極少數(shù)植株喪失了整合的外源基因。據(jù)Uze等報(bào)道,外源基因無論以單鏈還是雙鏈,無論是以線形還是以環(huán)形,都可以整合到小麥的基因組,但線形基因的轉(zhuǎn)化效率更高。Zupan等觀察到,農(nóng)桿菌VirE2蛋白能在轉(zhuǎn)基因植物細(xì)胞中協(xié)調(diào)細(xì)胞核吸取單鏈DNA。Srivastava等報(bào)道了“位點(diǎn)特異性重組” (site-specific recombination)方法,他們利用這一方法成功地將4個(gè)4拷貝插入基因位點(diǎn)轉(zhuǎn)化成單拷貝基因。
此外,Pederson等還利用熒光原位雜交(FlSH)研究了基因槍法導(dǎo)入的基因在轉(zhuǎn)基因小麥染色體上定位。他們觀察到,同一品種 (Florida)的不同轉(zhuǎn)基因株系,外源基因的插入位點(diǎn)不同,例如,一個(gè)株系的插入點(diǎn)在染色體6B,而另一株系的插入點(diǎn)在染色體2A。這類研究的深入,將有助于了解插入基因的“位置效應(yīng)”,從而更好地了解外源基因在轉(zhuǎn)基因小麥中的表達(dá)及其穩(wěn)定性。
5、小麥基因轉(zhuǎn)化存在的主要問題
盡管轉(zhuǎn)基因小麥的研究近年來進(jìn)展很快,但與雙子葉植物相比,甚至與同為谷物類的水稻和玉米相比,仍然有較大的差距。最明顯的差距是,轉(zhuǎn)基因雙子葉作物已經(jīng)有幾十個(gè)種類的120多個(gè)品種已經(jīng)用于生產(chǎn)實(shí)踐或已經(jīng)被批準(zhǔn)進(jìn)入大田實(shí)驗(yàn),轉(zhuǎn)基因水稻和玉米有若干品種也已經(jīng)用于生產(chǎn)實(shí)踐,而轉(zhuǎn)基因小麥基本還處在建立和優(yōu)化轉(zhuǎn)基因體系階段。筆者認(rèn)為,造成這種差異的主要原因或在小麥轉(zhuǎn)基因方面存在如下的問題:
第一,也是最主要的,小麥組織培養(yǎng)技術(shù)問題。小麥組織培養(yǎng)中植株再生率低和基因型依賴性很強(qiáng)的問題是限制轉(zhuǎn)基因成功及大幅度提高轉(zhuǎn)基因小麥數(shù)量的瓶頸。植株再生性強(qiáng)的小麥品種,如Bobwhite等,無論用基因槍法還是農(nóng)桿菌法都己經(jīng)得到轉(zhuǎn)基因植株,而再生性差的品種則用基因槍也無法得到轉(zhuǎn)基因植株。也正是由于品種的再生問題,使全世界的轉(zhuǎn)基因小麥都集中在少數(shù)幾個(gè)基因型,而這些基因型又并非生產(chǎn)實(shí)踐所需要的或在生產(chǎn)實(shí)踐中的應(yīng)用很有限。
第二,基因轉(zhuǎn)化的受體比較單一。未成熟胚及其衍生物是小麥轉(zhuǎn)基因的主導(dǎo)受體,而在世界發(fā)展中國家,有條件周年提供小麥未成熟胚者寥寥無幾。
第三,過份依獺基因槍法。目前轉(zhuǎn)基因小麥90%以上是用基因槍法獲得的,而基因槍法轉(zhuǎn)基因的缺點(diǎn)在雙子葉植物上已經(jīng)表現(xiàn)得很明顯,在此毋須多言。其實(shí),這兩個(gè)原因在本質(zhì)上是由第一個(gè)原因所引起的。另外,基因槍昂貴的價(jià)格也是附帶因素。
第四,對(duì)農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化單子葉植物,特別是轉(zhuǎn)化小麥的機(jī)理缺乏系統(tǒng)而深入的研究。目前人們已經(jīng)認(rèn)識(shí)到,不同種類的農(nóng)桿菌對(duì)同一種單子葉植物的侵染能力不同,甚至同一菌株在不同的培養(yǎng)條件下侵染能力也有明顯差異。而包括小麥在內(nèi)的一些單子葉植物本身也存在著一些不利于農(nóng)桿菌侵染的因素,如,細(xì)胞壁的果膠多糖的高度酯化而缺乏農(nóng)桿菌的附著位點(diǎn);分泌的愈傷誘導(dǎo)物少或缺乏或與雙子葉植物存在明顯的差異,不利于農(nóng)桿菌的轉(zhuǎn)化等。正是由于這些了解,人們通過選用適宜的農(nóng)桿菌菌株和植物表達(dá)載體、提高侵染時(shí)農(nóng)桿菌的濃度和延長侵染時(shí)間、在共培養(yǎng)時(shí)加入vir基因活化劑 (如AS,OH-AS,雙子葉植物傷流等)以及選用合適的受體基因型、外植體和培養(yǎng)基等,使農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化小麥有了重大突破,成功地獲得轉(zhuǎn)基因植株。
第五,小麥本身為異源6倍體,基因組較大而復(fù)雜,導(dǎo)入的外源基因的沉默與修飾更為嚴(yán)重。
第六,對(duì)轉(zhuǎn)基因小麥分子生物學(xué)證據(jù)作用的過分依賴。這在某中意義上曾扼制了極有優(yōu)勢(shì)的花粉管通道法在小麥轉(zhuǎn)基因上的應(yīng)用。
6、轉(zhuǎn)基因小麥的展望
隨著小麥多種基因轉(zhuǎn)化體系的建立或初步建立,小麥的轉(zhuǎn)基因研究的進(jìn)展在今后5年將會(huì)更快。但這種進(jìn)展將以更高效的植株再生體系的建立和完善為基礎(chǔ)。以基因槍為主體的轉(zhuǎn)基因研究將轉(zhuǎn)向以農(nóng)桿菌介導(dǎo)法為主體轉(zhuǎn)基因研究,這一研究將會(huì)優(yōu)化或完善農(nóng)桿菌介導(dǎo)的小麥轉(zhuǎn)基因體系。同時(shí),基因槍法轉(zhuǎn)化小麥將從研究階段進(jìn)入應(yīng)用階段,因而將有少量轉(zhuǎn)基因小麥品系或品種進(jìn)入大田試驗(yàn)或作為品系、品種釋放?;ǚ酃芡ǖ婪?,特別是它與農(nóng)桿菌結(jié)合的方法將被人們普遍接受并廣泛用于小麥轉(zhuǎn)基因的實(shí)踐。各種輔助農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法將走向成熟??箍股鼗蜃鳛檫x擇基因?qū)⒒驹谛←溵D(zhuǎn)基因上消失,代之而來的將是不同的抗除草劑基因、不同糖類和激素類基因。明顯易見而又對(duì)小麥有益的報(bào)告基因,如花色素基因等將會(huì)得到較普遍的應(yīng)用,因而轉(zhuǎn)化子的選擇效率將大為提高。更多的優(yōu)良農(nóng)業(yè)性狀基因?qū)⒈粚?dǎo)入和表達(dá),特別是提高面粉,營養(yǎng)價(jià)值、改良面粉加工性狀的品質(zhì)基因、提高植株抗病性的基因、提高植株抗旱性的基因和促進(jìn)植株氮的有效利用基因。更高強(qiáng)度的啟動(dòng)子和組織、器官特異性啟動(dòng)子將會(huì)被普遍利用,化學(xué)劑可調(diào)控啟動(dòng)子也將在部分先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)室利用,象 “位點(diǎn)特異性重組”等單拷貝插入技術(shù)將更加完善并得到應(yīng)用?;蚬こ绦坌圆挥w系將會(huì)得到完善,并初步用于雜交種子的生產(chǎn)??钩輨┗蛞矊⒂糜诳刂齐s種的純度。另外,對(duì)外源基因的插入位點(diǎn)和插入方式將有比較清楚的了解,從而對(duì)外源基因的表達(dá)與沉默將有更清楚的了解。同時(shí),反義基因技術(shù)將初步用于對(duì)小麥功能基因的研究。
或
一、植物的遺傳轉(zhuǎn)化
20世紀(jì)70年代末80年代初,人們用野生型Ri和Ti質(zhì)粒轉(zhuǎn)化煙草和馬鈴薯細(xì)胞獲得再生植株后,以Ti質(zhì)粒為載體的植物遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)隨之被建立。近年來植物的遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)得到了迅速發(fā)展,建立了多種轉(zhuǎn)化系統(tǒng)。按照基因引入受體植物細(xì)胞的方法,植物遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)大體可分為兩類:以載體為媒介的基因轉(zhuǎn)移和基因或DNA的直接轉(zhuǎn)移。所謂以載體為媒介的基因轉(zhuǎn)移就是將目的基因連于某一載體DNA上,然后通過寄主感染受體植物等途徑將外源基因轉(zhuǎn)入植物細(xì)胞的技術(shù)。DNA的直接轉(zhuǎn)移是指利用植物細(xì)胞生物學(xué)特性,通過物理、化學(xué)和生物學(xué)方法將外源基因轉(zhuǎn)入植物細(xì)胞的技術(shù)。
(一)載體法轉(zhuǎn)化 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化是最主要的一種載體轉(zhuǎn)化方法。利用經(jīng)過改造的農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒為載體可以高效地轉(zhuǎn)移外源基因。所獲得的轉(zhuǎn)化植物有兩種基本方法:一種是1979年Marton等以植物原生質(zhì)為受體的共培養(yǎng)法(ocultivation);一種是1985年Horsch等人建立的葉盤法(leaf disc cocultivation)。
共培養(yǎng)法是把農(nóng)桿菌與植物原生質(zhì)體共同培養(yǎng)以實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化的方法。其程序包括農(nóng)桿菌對(duì)初生細(xì)胞壁的原生質(zhì)體的轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)化細(xì)胞的篩選和誘導(dǎo)轉(zhuǎn)化細(xì)胞分化并再生植株。
葉盤法實(shí)際上是對(duì)共培養(yǎng)法加以改進(jìn)后而創(chuàng)立的一種轉(zhuǎn)化方法。用農(nóng)桿菌感染葉片外植體并短期共培養(yǎng)。在培養(yǎng)過程中,農(nóng)桿菌的vir基因被誘導(dǎo),它的活化可以啟動(dòng)T-DNA向植物細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。共培養(yǎng)后,也要進(jìn)行轉(zhuǎn)化的外植體的篩選、愈傷組織的培養(yǎng)、誘導(dǎo)分化等步驟,以得到再生植株。葉盤法由于不需進(jìn)行原生質(zhì)體操作等,方法簡(jiǎn)單,獲得轉(zhuǎn)化植株也更快,是用植物外植體為材料進(jìn)行轉(zhuǎn)基因的一個(gè)良好途徑。
農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化是大多數(shù)雙子葉植物轉(zhuǎn)化中常采用的方法,但由于農(nóng)桿菌具有宿主局限性,極少能感染單子葉植物,特別是一些重要的農(nóng)作物如水稻、小麥、玉米等對(duì)農(nóng)桿菌不敏感,難于應(yīng)用此法進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化。
除上述以Ti質(zhì)粒為載體的基因轉(zhuǎn)化外,還可以用脂質(zhì)體(liposome)為載體進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化。脂質(zhì)體是由磷脂組成的膜狀結(jié)構(gòu),因此可將DNA分子包裝在脂質(zhì)體內(nèi)以避免受體細(xì)胞DNase的降解,把DNA分子導(dǎo)入到植物的原生質(zhì)體中去。
(二)基因直接轉(zhuǎn)移的方法 這是指既不依賴于農(nóng)桿菌,也不依賴其他載體或媒介的一些基因轉(zhuǎn)移方法。
1.電激和電注射法 電脈沖能改變細(xì)胞膜的透性。通過高壓電脈沖的電激穿孔作用把外源DNA引入植物原生質(zhì)體的方法就稱為電激法(electroporation)。這種方法現(xiàn)已較廣泛地應(yīng)用于單子葉和雙子葉植物以及動(dòng)物的基因轉(zhuǎn)移,如20世紀(jì)80年代末用此法將新霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶(NPT Ⅱ)基因轉(zhuǎn)入玉米自交系的原生質(zhì)體,已再生成植株。
通過電激技術(shù)把基因直接引入完整的植物細(xì)胞或組織的方法,稱作電注射(electroinjection)。這種方法可避免原生質(zhì)體培養(yǎng)和再生成植株的繁雜操作與困難,因而具有巨大的應(yīng)用潛力。
2.基因槍法 基因槍法又稱粒子轟擊技術(shù)(particle bombardment)。這一方法是用粒子槍把表面吸附有外源DNA的金屬微粒高速地射進(jìn)植物細(xì)胞或組織。由于此法快速簡(jiǎn)便,不受宿主范圍限制,而受體植物細(xì)胞不需去除細(xì)胞壁,轉(zhuǎn)化率又高,被轉(zhuǎn)化的細(xì)胞或組織容易再生成植株,因而頗受關(guān)注。
3.微注射法 微注射法(microinjection)是利用顯微注射儀等,通過機(jī)械的方法將外源基因或DNA直接注入細(xì)胞核或細(xì)胞質(zhì)。與其他方法相比,這個(gè)方法對(duì)外源遺傳物質(zhì)的導(dǎo)入更為直接和有效。
微注射法除用于植物細(xì)胞外,近些年還發(fā)展到用于直接注射植物子房,這樣更有利于外源遺傳物質(zhì)對(duì)幼胚的轉(zhuǎn)化。這方面的工作我國于20世紀(jì)70年代即已進(jìn)行了理論與實(shí)踐的探索,并已獲得抗枯萎病的棉花轉(zhuǎn)化植株抗蟲棉等。
二、轉(zhuǎn)基因動(dòng)物技術(shù)及其應(yīng)用
(一)轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的概念 借助基因工程技術(shù)把外源目的基因?qū)肷臣?xì)胞、胚胎干細(xì)胞和早期胚胎,并在受體染色體上穩(wěn)定整合,使之經(jīng)過各種發(fā)育途徑得到能把外源目的基因傳給子代的個(gè)體,即轉(zhuǎn)基因動(dòng)物(transgenic animal)。轉(zhuǎn)入的目的基因稱為轉(zhuǎn)基因(transgene),這種轉(zhuǎn)移目的基因的過程稱為轉(zhuǎn)基因作用(transgenesis)。關(guān)于“轉(zhuǎn)基因”的概念,通常只限于動(dòng)、植物中經(jīng)基因工程技術(shù)進(jìn)行的基因轉(zhuǎn)移,因此品種間不論有性或無性雜交獲得新基因的途徑都不屬此范疇。
(二)轉(zhuǎn)基因動(dòng)物技術(shù) 轉(zhuǎn)基因動(dòng)物技術(shù)是20世紀(jì)80年代初發(fā)展起來的一項(xiàng)生物技術(shù),它克服了物種之間的生殖隔離,實(shí)現(xiàn)了動(dòng)物物種之間遺傳物質(zhì)的交換和重組。根據(jù)外源基因?qū)氲姆椒ê蛯?duì)象的不同,至今主要有3種途徑可以產(chǎn)生轉(zhuǎn)基因動(dòng)物,即顯微注射法、反轉(zhuǎn)錄病毒法和胚胎干細(xì)胞法。反轉(zhuǎn)錄病毒轉(zhuǎn)移基因的基本方法在前面已有簡(jiǎn)介,這里只介紹顯微注射法和胚胎干細(xì)胞法兩種。
1.受精卵原核顯微注射法 顯微注射技術(shù)是從動(dòng)物胚胎學(xué)研究移核實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ)上發(fā)展而來。20世紀(jì)80年代初期人們利用這一方法向動(dòng)物生殖細(xì)胞轉(zhuǎn)移外源基因,成功地建立了轉(zhuǎn)基因小鼠。1985年轉(zhuǎn)基因綿羊和轉(zhuǎn)基因豬問世,以后轉(zhuǎn)基因大鼠、兔、雞、牛、魚等都已陸續(xù)取得成功,可見顯微注射法是迄今應(yīng)用得較為普遍而又最有成效的一種獲得轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的技術(shù)。
本方法是在顯微鏡下,用直徑約為1μm的玻璃管直接插入受精卵的雄原核內(nèi),將毛細(xì)管內(nèi)所帶有的外源基因的DNA注入原核,然后將其移植到假孕母體輸卵管或子宮內(nèi)并發(fā)育成子代個(gè)體。為了解轉(zhuǎn)基因的整合情況,可酌情應(yīng)用斑點(diǎn)雜交、多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)或Southern印跡雜交等方法對(duì)子代個(gè)體DNA進(jìn)行檢測(cè)。
顯微注射法的優(yōu)點(diǎn)是導(dǎo)入的外源基因片段可長達(dá)50 kb,且無需載體,外源基因在宿主染色體上的整合率相對(duì)較高。其不足之處是外源基因的整合是隨機(jī)的,因而難以控制其整合率;再者,對(duì)外源基因能否穩(wěn)定整合于受體基因組的檢測(cè),必須等到子一代個(gè)體出生后經(jīng)過選擇才能確定,不利于在生育期長、產(chǎn)仔少的大家畜中應(yīng)用。
2.胚胎干細(xì)胞介導(dǎo)法 胚胎干細(xì)胞(embryonic stem cell,ES)是指從哺乳動(dòng)物胚胎囊胚期內(nèi)的細(xì)胞團(tuán)中分離出來的尚未分化的胚胎細(xì)胞,這種細(xì)胞具有發(fā)育的多能性,能夠分化出各種組織。20世紀(jì)80年代中期人們開始研究利用ES細(xì)胞獲得轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的方法。這個(gè)途徑是將外源基因直接導(dǎo)入ES細(xì)胞,經(jīng)體外培養(yǎng)篩選后再注入到受體囊胚腔中,與其中的囊胚細(xì)胞聚集在一起,成為受體胚胎的一部分,參與其分化。由這種胚胎發(fā)育而成嵌合體的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物,即其中有一部分組織來源于整合有外源基因的供體ES細(xì)胞。在嵌合過程中,被轉(zhuǎn)化的ES細(xì)胞分化而成的生殖細(xì)胞可通過雜交將引入的外源基因傳遞下去。
在以胚胎干細(xì)胞為媒介獲得轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的技術(shù)中,既可以用多種方法將外源基因?qū)隕S細(xì)胞,且細(xì)胞的鑒定、篩選比較方便,又可預(yù)先在細(xì)胞水平上測(cè)定外源基因的拷貝數(shù)、定位和表達(dá)的水平以及插入的穩(wěn)定性等,而且將ES細(xì)胞注入囊胚的操作較易進(jìn)行,整合率相對(duì)較高。只是建立ES細(xì)胞系本身就是一項(xiàng)難度極高的工作,目前小鼠ES細(xì)胞系雖已建立,但在豬、羊中還未能得到真正穩(wěn)定的ES細(xì)胞株。
(三)轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的應(yīng)用 轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的研究?jī)?nèi)容非常廣泛,20世紀(jì)80~90年代以來從基礎(chǔ)理論到應(yīng)用技術(shù)在深度和廣度上都有了很大發(fā)展,并已日漸由實(shí)驗(yàn)室走向生產(chǎn)實(shí)踐。
1.在基因表達(dá)調(diào)控研究方面的應(yīng)用 利用轉(zhuǎn)基因動(dòng)物可作為在體內(nèi)研究外源基因表達(dá)調(diào)控的“反應(yīng)器”,下面僅就DNA順式調(diào)控元件和基因在發(fā)育中的時(shí)空調(diào)節(jié)為例予以介紹。
(1)順式調(diào)控元件的研究 異常的脂蛋白水平與動(dòng)脈粥樣硬化等疾病有關(guān)。人類有5種脂蛋白,各自含有不同的載脂蛋白?,F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)約有17種載脂蛋白,它們的編碼基因已測(cè)序,是用于研究心血管疾病的候選基因。把載脂蛋白基因轉(zhuǎn)入小鼠,可用來研究人脂蛋白代謝、調(diào)控以及動(dòng)脈粥樣硬化。在研究載脂蛋白基因組織特異性表達(dá)的順式調(diào)控元件時(shí),發(fā)現(xiàn)有兩簇載脂蛋白基因凋節(jié)的組織特異性表達(dá)(圖19-15)。一簇包括A-Ⅰ、C-Ⅲ和 A-Ⅳ基因,定位于人11號(hào)染色體長臂2區(qū)3帶(11q23),是按A-Ⅰ、C-Ⅲ、A-Ⅳ的順序組成。C-Ⅲ的轉(zhuǎn)錄方向與其他兩個(gè)基因相反。 A-Ⅰ和C-Ⅲ主要在肝和小腸中表達(dá),A-Ⅳ主要在小腸表達(dá)。在 C-Ⅲ基因的-0.2~-1.4bp之間是調(diào)節(jié) A-Ⅰ基因在小腸中表達(dá)的區(qū)域。這個(gè)區(qū)域也是 C-Ⅲ和A-Ⅳ基因在小腸表達(dá)的凋控元件,表明這一元件可以調(diào)節(jié)整個(gè)載脂蛋白基因簇在小腸的表達(dá)。另一基因簇定位于19號(hào)染色體長臂1區(qū)3帶(19q13),包含有E、C-Ⅰ和C-Ⅱ基因,它們按E、C-Ⅰ、C-Ⅱ順序排列。E基因主要在肝臟和大部分身體組織中表達(dá),但表達(dá)水平低。以后發(fā)現(xiàn)在C-Ⅰ基因和C-Ⅱ基因之間有
基因工程是指重組DNA技術(shù)的產(chǎn)業(yè)化設(shè)計(jì)與應(yīng)用,包括上游技術(shù)和下游技術(shù)兩大組成部分。上游技術(shù)指的是基因重組、克隆和表達(dá)的設(shè)計(jì)與構(gòu)建(即重組DNA技術(shù));而下游技術(shù)則涉及到基因工程菌或細(xì)胞的大規(guī)模培養(yǎng)以及基因產(chǎn)物的分離純化過程。
以下為其發(fā)展:
第一代基因工程 蛋白多肽基因的高效表達(dá) (經(jīng)典基因工程)
第二代基因工程 蛋白編碼基因的定向誘變 (蛋白質(zhì)工程)
第三代基因工程 代謝信息途徑的修飾重構(gòu) (代謝途徑工程 )
第四代基因工程 全基因組或染色體的轉(zhuǎn)移 (基因組工程)
代謝工程則是基因工程的延伸。即利用基因工程技術(shù)定向改造細(xì)胞的代謝途徑,以改善產(chǎn)物的形成和細(xì)胞的性能。
基因工程通常只涉及少量基因的改造,比如將編碼某種蛋白藥物的單一基因轉(zhuǎn)入酵母,然后用該酵母發(fā)酵生產(chǎn)該藥物。但是代謝工程會(huì)涉及大幅度的基因改變,比如為在大腸桿菌中生產(chǎn)某種代謝產(chǎn)物,比如紫杉醇(尚在研究階段),必須把一系列相關(guān)途徑的酶的基因全部導(dǎo)入大腸桿菌,并且敲除不必要和有害的大腸桿菌中原本就有的代謝通路,以構(gòu)建出一整套大腸桿菌中原本沒有的紫杉醇的代謝途徑,使大腸桿菌能夠生產(chǎn)紫杉醇。
例如在酵母糖基人源化的改造中,共敲除了酵母的大約11個(gè)基因,然后導(dǎo)入大約5個(gè)人的糖基轉(zhuǎn)移酶基因才初步實(shí)現(xiàn)(在Science雜志中發(fā)表)。即代謝工程的實(shí)質(zhì)就是基因工程,只是涉及的基因改變的量遠(yuǎn)比基因工程巨大
而合成生物學(xué)的目標(biāo),則是試圖采用從自然界分割出來的標(biāo)準(zhǔn)生物學(xué)元件(可被修飾、重組乃至創(chuàng)造),進(jìn)行理性(設(shè)計(jì))的重組(乃至從頭合成)以獲得新的生命(生物體)。
比如
1、人工合成單細(xì)胞的模型(Jack W. Szostak (Nature, 2008));
2、2008年完全利用化學(xué)方法合成長度達(dá)582970bp的生殖道支原體(M. genitalium)的全基因組,克隆到酵母中;為了突出是人工合成的基因組,多處插入了“水印”序列;該工作向創(chuàng)造“人造生命”又邁近了一步(Science);
3、2007年,絲狀支原體(Mycoplasma mycoides)的幾乎不帶蛋白質(zhì)的裸genomic DNA移植到山羊支原體(M. capricolum)細(xì)胞中,首次實(shí)現(xiàn)了不同細(xì)菌種類的整個(gè)基因組的替換,將一種物種變?yōu)榱硪环N物種,向從零開始構(gòu)建簡(jiǎn)單的基因組邁出關(guān)鍵 一步(Science)。
等等
合成生物學(xué)即:
以系統(tǒng)生物學(xué)思想為指導(dǎo)
綜合化學(xué)(生物化學(xué))技術(shù)、物理(生物物理)技術(shù)、信息(生物信息)技術(shù),
利用基因和基因組的基本要素,
設(shè)計(jì)、改造、重建或制造:
生物分子、
生物體部件、
生物反應(yīng)系統(tǒng)、
代謝途徑與過程、
具生命活動(dòng)能力的細(xì)胞和生物個(gè)體
合成生物學(xué)與代謝工程在思想上與基因工程最明顯不同之一就是,前兩者特別注重代謝流的量化描述(雖然現(xiàn)在很難做到),講究基因的協(xié)調(diào)表達(dá)和表達(dá)量的準(zhǔn)確控制
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