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CRISPR基因編輯技術在進化發(fā)育生物學領域掀起熱潮

佚名 2024-06-06 19:57:01

2016年08月22日訊 從1893年以來的很多個夏天里

,年輕的發(fā)育和進化生化學家們都會蜂擁來到美國馬薩諸塞州伍茲霍爾(Woods Hole)開始學習掌握“職業(yè)”的技巧
;在聞名世界的麻省國家海洋生物實驗室( Marine Biological Laboratory)里
,每年進行胚胎學實驗課程的學生都會對海膽
、櫛水母(腔腸動物的一種)以及來自不同動物的嫁接細胞進行解剖
,但在過去三年里
,有強烈學習欲望的“學徒們”開始了另一項工作:基因編輯

這種名為CRISPR-Cas9的精確

、有效的基因編輯技術已經開始在全球多個生命科學研究實驗室開始風靡,如今該技術已經席卷了整個發(fā)育生物學領域
,研究者們也試圖去解釋進化適應性背后所發(fā)生的發(fā)育改變
。相比簡單地推斷引發(fā)歷史性轉折的原因,比如解釋魚類的四肢發(fā)育奧秘
,科學家們更希望利用CRISPR基因編輯技術直接檢查這種假設
,實際上這種理論是非常簡單的,即關閉認為參與魚鰭發(fā)育的基因的表達
,同時觀察是否魚類開始形成組裝“足部”的組織

而這正是研究者們在Nature雜志上所報道的,他們利用CRISPR技術來幫助解釋魚類足部發(fā)育以及開始行走的奧秘

,而其他研究者則利用這種技術來確定蝴蝶如何進化出敏銳的色覺以及介蟲如何獲得爪子
。來自喬治華盛頓大學的進化生物學家Arnaud Martin則指出,CRISPR是整個生物學研究領域的巨大變革
,但對于發(fā)育生物學領域而言
,該技術則會帶來一定的革新能力,利用CRISPR技術我們就能進行此前無法進行的工作

鰭如何變成腳

來自芝加哥大學的研究者Neil Shubin利用基因編輯技術研究了在進化歷程中,魚鰭的頂端或鰭刺如何被四足陸地脊椎動物的腳或者足趾所替代

;如今科學家們都知道魚類也可以發(fā)育出四肢
,2004年時研究者Shubin發(fā)現了3.75億年前的化石,而該化石似乎就幫助我們抓住了進化變遷的關鍵過程
,研究者認為
,足部的進化或許是進化中的一種新事物,因為鰭刺和足部都是由不同類型的骨質所組成的

然而基因編輯技術就可以讓研究者改變主意

,Shubin的研究團隊利用CRISPR對缺失多個hox13基因的斑馬魚進行了工程化基因編輯,hox13基因在拋棄機體鰭條上扮演著重要的作用。研究者指出
,沒有任何一個突變體能夠完全生長出成熟的足部結構
,但某些突變體卻擁有排成指狀的鰭結構(fingery fins),這些結構由和構建四足動物手指和腳趾的相同類型骨質結構所構成
,研究者Shubin說道
,作為一名古生物學家,我認為這兩種類型的骨質結構在發(fā)育和進化上完全不具有關聯性
,而相關的研究結果正反駁了這一點

斑馬魚是一種流行的模式動物,科學家們完全可以在實驗室對其基因組進行有規(guī)律地操作

,但CRISPR技術則會大大加速整個實驗過程
,下一步研究者將會去敲除和擁有四肢的古代魚類非常相近的魚類機體中的hox13基因,這些實驗能夠順利進行得益于CRISPR技術的幫助

對蟹類和蝴蝶進行基因編輯

目前幾乎找不到任何理由認為CRISPR基因編輯技術不能用于其它物種,研究者Martin認為CRISPR似乎可以應用于任何有機體

,他如今已經成功將該技術應用于海洋甲殼類動物Parhyale hawaiensis中
。今年1月份,刊登在國際雜志Current Biology上的一項研究報告中
,研究者Martin與其同事Nipam Patel就通過研究發(fā)現
,使得物種機體中不同的Hox基因表達失活就可以干擾物種機體特殊附屬物比如觸角和爪子的發(fā)育,如果科學家們可以成功在實驗室繁育動物的話
,那么其或許就能夠利用CRISPR技術對動物的受精卵進行研究

來自紐約大學的研究者Claude Desplan已經成功在黃鳳蝶中成功地應用了CRISPR技術,相關研究刊登在了上個月的Nature雜志上

,文章中研究者檢測了一種理論
,即相比諸如果蠅等昆蟲而言,黃鳳蝶眼睛中的光感受器如何檢測廣譜的色譜
,如今他們正在進行實驗來將基因編輯技術應用于黃蜂和螞蟻中

到目前為止發(fā)育生物學家已經開始利用CRISPR技術消除基因的活性或引入基因,比如引入可以編碼綠色熒光蛋白的基因

,從而實現對動物發(fā)育的追蹤
。但研究者Martin期待更多研究者在不久的將來利用這種新型工具來精確改變動物機體的DNA序列,從而檢測特殊遺傳改變的相關理論
,這就包括調節(jié)性DNA序列的改變如何影響基因活性的改變
,從而誘發(fā)機體的適應性改變,比如四足動物長出四肢

耶魯大學的研究者Bhart-Anjan Bhullar認為

,很多研究者都對古代過渡物種的DNA序列做出了一定可靠的推測,并且利用CRISPR將這些DNA序列插入到了活體的動物機體中進行研究;去年他們的研究團隊就利用化學物成功修飾了雞的發(fā)育過程
,研究者認為這可以幫助將獸腳類恐龍的鼻子塑造成為現代鳥類的喙
,同時他們還希望利用CRISPR進行后續(xù)的實驗。

參與上個月胚胎學課程的研究者Bhullar表示

,他對學生們進行相關基因編輯試驗的成功案例深有印象
,而且目前很多科學家已經利用CRISPR技術對斑馬魚、青蛙
、海鞘等動物開始編輯
。最后Bhullar說道,在CRISPR基因編輯工具的幫助下
,對任何東西進行操作都不成問題
,我們希望基于CRISPR的基因編輯技術能夠快速成為進化發(fā)育生物學研究中的一項標準。

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